294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0248 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  100 
 
 		 331 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  85.5 
 
 		 331 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  85.93 
 
 		 331 aa  534  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  59.45 
 
 		 332 aa  359  3e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  58.51 
 
 		 328 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  59.56 
 
 		 342 aa  348  5e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  59.18 
 
 		 341 aa  348  6e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  61.11 
 
 		 323 aa  348  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  59.28 
 
 		 327 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  59.49 
 
 		 327 aa  342  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  59.13 
 
 		 328 aa  340  2e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  60.14 
 
 		 328 aa  327  1.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  50.9 
 
 		 334 aa  271  1e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  233  5e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  38.79 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  38.91 
 
 		 330 aa  215  9e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  39.81 
 
 		 336 aa  207  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  42.55 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  34.41 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  37.46 
 
 		 331 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  35 
 
 		 333 aa  193  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  33.13 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.58 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  31.69 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  33.03 
 
 		 326 aa  175  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  32.72 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  32.32 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  31.1 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.79 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 479 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  36.97 
 
 		 471 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  37.17 
 
 		 481 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  35.68 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  35.92 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0210  thiamine-phosphate kinase  33.23 
 
 		 323 aa  71.6  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.631674 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  35.75 
 
 		 332 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  31.69 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  34.7 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  35.04 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  34.02 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  29.15 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  35.47 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  35.47 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2509  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 309 aa  67  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0452713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.46 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  28.67 
 
 		 328 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  31.65 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3712  thiamine monophosphate kinase  34.62 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.957704  normal  0.0722604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  29.32 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.77 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2786  thiamine-monophosphate kinase  36.28 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.249241  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  30.56 
 
 		 327 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  32 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  34.91 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  29.02 
 
 		 325 aa  62.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  26.54 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  31.03 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  32.33 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  27.54 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  28.43 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0529  thiamine-monophosphate kinase  32.53 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0957799  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  33.33 
 
 		 332 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2811  thiamine-monophosphate kinase  34.76 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.612924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  33.47 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  30.19 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  35.38 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  34.39 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  23.75 
 
 		 325 aa  58.5  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  24.38 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.39 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  35.16 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  33.47 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  26.81 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2755  thiamine monophosphate kinase  35.62 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.281901  normal  0.6872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1075  thiamine monophosphate kinase  32.02 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.255519  hitchhiker  0.000417977 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1028  thiamine monophosphate kinase  31.58 
 
 		 326 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1257  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  28.86 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0223  thiamine-monophosphate kinase  32.61 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0397  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100912  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3308  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  34.53 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0711  thiamine-monophosphate kinase  36.18 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  23.83 
 
 		 327 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 323 aa  57  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  25.08 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  30.8 
 
 		 323 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  30.38 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3282  thiamine monophosphate kinase  32.03 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  29.96 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4471  thiamine-monophosphate kinase  32.8 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.118432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>