204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4748 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  100 
 
 		 334 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  57.06 
 
 		 328 aa  329  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  54.63 
 
 		 327 aa  315  5e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  54.35 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  53.25 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  51.85 
 
 		 328 aa  292  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  51.83 
 
 		 341 aa  290  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  52.71 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  50.3 
 
 		 332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  51.34 
 
 		 331 aa  286  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  50.94 
 
 		 328 aa  283  3.0000000000000004e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  53.58 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  56.06 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  43.96 
 
 		 325 aa  222  7e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  37.05 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  40.45 
 
 		 338 aa  210  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  37.76 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  38.25 
 
 		 330 aa  186  7e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  39.35 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  38.75 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  32.42 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  34.45 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  35.28 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  32.51 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  31.5 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  30.37 
 
 		 327 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  28.48 
 
 		 324 aa  149  5e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  30.98 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  30.37 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 		 479 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  37.33 
 
 		 481 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  37.22 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  35.84 
 
 		 486 aa  122  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  27.5 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  33.64 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  26.64 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3014  thiamine monophosphate kinase  32.11 
 
 		 361 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.783652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  21.43 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  28.67 
 
 		 528 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  28.14 
 
 		 339 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2604  thiamine monophosphate kinase  32.08 
 
 		 361 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0796602  normal  0.511018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2768  thiamine monophosphate kinase  30.45 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.086077  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  32.38 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.85 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389559  normal  0.625325 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.77 
 
 		 768 aa  57.8  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.86 
 
 		 781 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  24 
 
 		 325 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.22 
 
 		 599 aa  57  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  25.1 
 
 		 352 aa  56.2  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.96 
 
 		 737 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3561  thiamine-monophosphate kinase  26.84 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  29.58 
 
 		 323 aa  55.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.44 
 
 		 737 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.72 
 
 		 761 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0402  hypothetical protein  25 
 
 		 339 aa  54.3  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  27.8 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0101  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.57 
 
 		 693 aa  53.9  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00123844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  31.34 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  31.25 
 
 		 764 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.22 
 
 		 601 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  32.76 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.32 
 
 		 752 aa  53.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0345  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 324 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.277053  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  30.53 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  28.06 
 
 		 346 aa  52.8  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.63 
 
 		 735 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  26.21 
 
 		 327 aa  52.4  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.26 
 
 		 736 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.6 
 
 		 744 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0356  thiamine-monophosphate kinase  31.47 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1952  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.69 
 
 		 734 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2178  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.94 
 
 		 697 aa  51.2  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0398131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0038  AIR synthase related protein  25.7 
 
 		 293 aa  51.6  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4475  thiamine-monophosphate kinase  33.66 
 
 		 329 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.599379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  28.47 
 
 		 337 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.49 
 
 		 741 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.76 
 
 		 736 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  24.24 
 
 		 346 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0477  thiamine-monophosphate kinase  29.32 
 
 		 306 aa  50.8  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.44 
 
 		 601 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4320  thiamine-monophosphate kinase  37.78 
 
 		 329 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.267415  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.97 
 
 		 736 aa  50.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  23.11 
 
 		 371 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  33.09 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  25.87 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4456  thiamine-monophosphate kinase  37.31 
 
 		 329 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  30.94 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  30.99 
 
 		 339 aa  49.7  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  27.43 
 
 		 334 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0398  thiamine-monophosphate kinase  24.08 
 
 		 350 aa  49.3  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.34 
 
 		 736 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  31.25 
 
 		 329 aa  49.3  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2057  thiamine-monophosphate kinase  25.51 
 
 		 358 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.82 
 
 		 733 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  30 
 
 		 758 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.46 
 
 		 733 aa  49.3  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  28.81 
 
 		 761 aa  48.9  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  20.66 
 
 		 327 aa  48.9  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  28.69 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  26.38 
 
 		 350 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>