More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0117 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  100 
 
 		 323 aa  638    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  69.54 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  68.31 
 
 		 326 aa  426  1e-118  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  65.32 
 
 		 304 aa  397  1e-109  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  46.53 
 
 		 335 aa  249  3e-65  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  46.91 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  43.2 
 
 		 337 aa  246  4e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  45.09 
 
 		 330 aa  243  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  45.24 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  39.08 
 
 		 331 aa  227  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  38.56 
 
 		 327 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  39.27 
 
 		 330 aa  198  9e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  37.06 
 
 		 348 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  32.91 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  35.99 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  39.6 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  37.84 
 
 		 528 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  41.83 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  37.15 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  34.67 
 
 		 345 aa  165  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  33.33 
 
 		 318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  35 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  30.84 
 
 		 357 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  35.45 
 
 		 346 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  29.55 
 
 		 359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  30.84 
 
 		 357 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  35.2 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  30.12 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  30.27 
 
 		 341 aa  122  8e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.3 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.47 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.14 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.68 
 
 		 330 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.73 
 
 		 348 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.89 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.74 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.95 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.71 
 
 		 334 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  30.58 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.87 
 
 		 349 aa  106  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.41 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.04 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.41 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  31.33 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.29 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.74 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  29.71 
 
 		 347 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.03 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.13 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  34.39 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.03 
 
 		 336 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.54 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.23 
 
 		 352 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.78 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.59 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.38 
 
 		 352 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.21 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  33.33 
 
 		 356 aa  99.4  7e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.56 
 
 		 330 aa  99.4  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.8 
 
 		 348 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.51 
 
 		 351 aa  97.1  3e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.92 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.44 
 
 		 355 aa  97.1  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00490  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.82 
 
 		 341 aa  97.4  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00620  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.36 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00293327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.63 
 
 		 354 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.46 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.9 
 
 		 334 aa  97.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.51 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.29 
 
 		 336 aa  96.3  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.88 
 
 		 345 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.67 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.42 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  30.15 
 
 		 351 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.09 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.74 
 
 		 344 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.16 
 
 		 352 aa  93.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.37 
 
 		 347 aa  93.2  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.8 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.83 
 
 		 351 aa  93.2  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.5 
 
 		 341 aa  92.4  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.83 
 
 		 344 aa  92.4  9e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.49 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.49 
 
 		 348 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  30 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.66 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.89 
 
 		 370 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.03 
 
 		 352 aa  91.7  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.58 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.22 
 
 		 349 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.82 
 
 		 335 aa  91.3  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.62 
 
 		 334 aa  91.7  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1281  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.62 
 
 		 370 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.454857 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.08 
 
 		 340 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.88 
 
 		 356 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.65 
 
 		 341 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3361  hypothetical protein  31.74 
 
 		 340 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2161  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.58 
 
 		 340 aa  90.1  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.072502  normal  0.073432 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.55 
 
 		 347 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1309  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.57 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.19082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>