281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1476 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  92.72 
 
 		 357 aa  685    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  93.84 
 
 		 357 aa  697    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  100 
 
 		 359 aa  736    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  47.25 
 
 		 345 aa  326  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  39.71 
 
 		 341 aa  278  1e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  39.53 
 
 		 332 aa  276  3e-73  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  40.64 
 
 		 335 aa  262  8e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  37.39 
 
 		 346 aa  252  8.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  36.42 
 
 		 345 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  38.51 
 
 		 528 aa  229  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  36.92 
 
 		 340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  35.76 
 
 		 345 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  32.65 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  31.04 
 
 		 331 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  30.61 
 
 		 335 aa  157  4e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  32.28 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  29.88 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  30.88 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  29.55 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  29.35 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  33.33 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  28.1 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  30 
 
 		 348 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  28.7 
 
 		 330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  29.07 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  26.62 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  27.27 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  27.92 
 
 		 326 aa  93.2  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.54 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.54 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.59 
 
 		 370 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.33 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.57 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.55 
 
 		 352 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.15 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.77 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.19 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.56 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.62 
 
 		 352 aa  83.2  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.37 
 
 		 344 aa  83.2  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  26 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.02 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.77 
 
 		 336 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.14 
 
 		 334 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.39 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  26.37 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  26.01 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.55 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.3 
 
 		 337 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.7 
 
 		 330 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.17 
 
 		 349 aa  78.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.91 
 
 		 348 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.1 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  27.27 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.75 
 
 		 324 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.44 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1093  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.1 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.823142  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.75 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.8 
 
 		 352 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.88 
 
 		 356 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.86 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.51 
 
 		 341 aa  75.5  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.26 
 
 		 350 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.41 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2176  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.18 
 
 		 338 aa  75.5  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.239453 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.52 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  22.83 
 
 		 346 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.57 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.98 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.57 
 
 		 348 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.01 
 
 		 366 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1454  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.81 
 
 		 347 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.42 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.38 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.97 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.17 
 
 		 351 aa  73.6  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1948  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.61 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.968187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.47 
 
 		 351 aa  72.8  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.72 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1095  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.16 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.05 
 
 		 339 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  26.21 
 
 		 348 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.83 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.05 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.05 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.03 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.69 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.88 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.68 
 
 		 328 aa  70.1  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.92 
 
 		 348 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.51 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.75 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.22 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0510  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.24 
 
 		 340 aa  69.7  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.268984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>