More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1681 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 
330 aa  661    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  55.62 
 
 
327 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  50.3 
 
 
331 aa  317  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  39.82 
 
 
325 aa  255  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  41.09 
 
 
348 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  38.02 
 
 
335 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  37.21 
 
 
337 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  40.26 
 
 
304 aa  203  3e-51  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  39.27 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  35.52 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  36.25 
 
 
330 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  35.93 
 
 
335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  35.22 
 
 
326 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  36.36 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  40.22 
 
 
330 aa  182  8.000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  30.93 
 
 
341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  30.45 
 
 
528 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  29.88 
 
 
359 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  30.75 
 
 
345 aa  153  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  29.59 
 
 
357 aa  153  4e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  29.29 
 
 
357 aa  150  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  31.05 
 
 
345 aa  149  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  33.89 
 
 
326 aa  144  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  27.66 
 
 
332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  34.54 
 
 
318 aa  139  8.999999999999999e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  26.14 
 
 
335 aa  130  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  26.95 
 
 
340 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  26.55 
 
 
346 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  27.21 
 
 
345 aa  115  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  29.77 
 
 
347 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0148  AIR synthase-like protein  26.25 
 
 
332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.25 
 
 
337 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  30.8 
 
 
346 aa  106  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.15 
 
 
342 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.15 
 
 
342 aa  105  9e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.57 
 
 
342 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.32 
 
 
334 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.71 
 
 
362 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.74 
 
 
339 aa  103  4e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.97 
 
 
334 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.97 
 
 
334 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.11 
 
 
347 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.49 
 
 
336 aa  101  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.83 
 
 
336 aa  100  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.55 
 
 
339 aa  100  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.83 
 
 
348 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.57 
 
 
370 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0515  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.1 
 
 
340 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0993017 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.59 
 
 
390 aa  99.4  7e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.85 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.85 
 
 
339 aa  99.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.02 
 
 
337 aa  99.4  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1426  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.55 
 
 
332 aa  99  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.505922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.37 
 
 
336 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.56 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0506  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.4 
 
 
341 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.777692  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.92 
 
 
335 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.88 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0501  hydrogenase expression/formation protein HypE  30 
 
 
341 aa  96.3  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.790164  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.91 
 
 
366 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.6 
 
 
341 aa  96.3  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 
349 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  28 
 
 
368 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  27.21 
 
 
335 aa  94  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.09 
 
 
336 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.76 
 
 
334 aa  93.6  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.53 
 
 
344 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2187  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.03 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.322535  normal  0.295855 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.37 
 
 
334 aa  92  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.37 
 
 
338 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.98 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.04 
 
 
348 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 
349 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.27 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.12 
 
 
338 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.92 
 
 
350 aa  91.3  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.63 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.98 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.58 
 
 
328 aa  90.5  3e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.07 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.33 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.82 
 
 
337 aa  90.5  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1277  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.19 
 
 
332 aa  90.1  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.72 
 
 
348 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.94 
 
 
354 aa  90.5  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.7 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.3 
 
 
342 aa  89.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.71 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.62 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.27 
 
 
345 aa  89.7  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.76 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.13 
 
 
331 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.02 
 
 
348 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.24 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.25 
 
 
367 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  25 
 
 
345 aa  87.8  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.62 
 
 
352 aa  88.6  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.4 
 
 
351 aa  88.2  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.42 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>