More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0465 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 
345 aa  690    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  53.59 
 
 
335 aa  346  3e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  50.89 
 
 
346 aa  341  1e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  51.17 
 
 
345 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  47.28 
 
 
357 aa  330  2e-89  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  47.25 
 
 
359 aa  326  3e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  47.28 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  43.71 
 
 
332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  47.25 
 
 
340 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  44.05 
 
 
341 aa  279  5e-74  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  40.35 
 
 
345 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  40.6 
 
 
528 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  34.77 
 
 
335 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  34.67 
 
 
323 aa  165  9e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  33.63 
 
 
335 aa  161  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  34.29 
 
 
326 aa  160  3e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  30.36 
 
 
348 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  31.8 
 
 
304 aa  154  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  29.97 
 
 
331 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  31.05 
 
 
330 aa  149  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  29.94 
 
 
337 aa  143  5e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  28.06 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  34.78 
 
 
330 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  33.14 
 
 
330 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  32.63 
 
 
326 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  24.52 
 
 
325 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  32.76 
 
 
338 aa  119  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  29.96 
 
 
346 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.42 
 
 
348 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  29.62 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  27.8 
 
 
351 aa  88.6  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  27.54 
 
 
326 aa  88.2  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.37 
 
 
345 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.64 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2362  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.01 
 
 
356 aa  87.4  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.504762  normal  0.0693111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.42 
 
 
354 aa  86.7  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.42 
 
 
349 aa  86.3  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.92 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.39 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.04 
 
 
337 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.03 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.57 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.82 
 
 
348 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.06 
 
 
351 aa  83.2  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.55 
 
 
341 aa  82  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3147  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.62 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.02 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.45 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.89 
 
 
367 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.2 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.43 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.87 
 
 
342 aa  80.5  0.00000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4587  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.54 
 
 
437 aa  80.5  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2439  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.43 
 
 
337 aa  80.5  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.62 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1029  AIR synthase-like protein  27.21 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0402037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.62 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.71 
 
 
366 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.33 
 
 
336 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.33 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2867  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.33 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.33 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.6 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  27.33 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.72 
 
 
367 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  27.33 
 
 
322 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.78 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.13 
 
 
340 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.33 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.04 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.02 
 
 
348 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.27 
 
 
355 aa  79  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.72 
 
 
336 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.71 
 
 
349 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.96 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.9 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.5 
 
 
349 aa  77.4  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  28.12 
 
 
335 aa  76.6  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.35 
 
 
336 aa  77  0.0000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.47 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.47 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.47 
 
 
355 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.25 
 
 
339 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.8 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.45 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.66 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.4 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1704  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.2 
 
 
350 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.337224 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.52 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.85 
 
 
349 aa  75.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  27 
 
 
334 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.38 
 
 
331 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3400  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.8 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.67 
 
 
352 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.19 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.62 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0390  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.56 
 
 
335 aa  74.3  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.117934  hitchhiker  0.0000000437188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.69 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.24 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3824  Hydrogenase maturation factor-like protein  30.4 
 
 
446 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0729982 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>