More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1222 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  100 
 
 		 345 aa  697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  49.56 
 
 		 528 aa  281  8.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  37.69 
 
 		 341 aa  245  8e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  40.35 
 
 		 345 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  37.21 
 
 		 357 aa  227  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  38.48 
 
 		 335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  36.05 
 
 		 357 aa  220  3e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  35.76 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  36.5 
 
 		 332 aa  218  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  38.81 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  35.45 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  35.48 
 
 		 326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  35.99 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  34.49 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  37.66 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  37.46 
 
 		 335 aa  175  9e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  32.84 
 
 		 331 aa  170  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  36.64 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  32.35 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  37.58 
 
 		 330 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  29.25 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  30.75 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  36.14 
 
 		 338 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  32.84 
 
 		 330 aa  146  6e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  34.47 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  29.97 
 
 		 325 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  31.96 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  29.34 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.43 
 
 		 337 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1959  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.83 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.57 
 
 		 352 aa  92  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1640  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.66 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.98 
 
 		 338 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.97 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.57 
 
 		 337 aa  87.8  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  27.09 
 
 		 347 aa  87.8  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1420  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.83 
 
 		 342 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.42 
 
 		 349 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.48 
 
 		 368 aa  87  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.94 
 
 		 337 aa  86.7  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.86 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.6 
 
 		 348 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.68 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.62 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.8 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2524  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.82 
 
 		 342 aa  84  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.021804  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.12 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.2 
 
 		 325 aa  84  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2740  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.46 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.68 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.12 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.29 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.29 
 
 		 339 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.23 
 
 		 352 aa  82.4  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03920  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.94 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2011  hydrogenase maturation  26.84 
 
 		 346 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08030  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.83 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.15 
 
 		 334 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.1 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.25 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0148  AIR synthase-like protein  21.82 
 
 		 332 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.5 
 
 		 352 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.95 
 
 		 355 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.16 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.42 
 
 		 336 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.16 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  24.41 
 
 		 318 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.91 
 
 		 338 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.09 
 
 		 366 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.65 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.07 
 
 		 336 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0729  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.56 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.344084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.26 
 
 		 336 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.44 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2484  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.84 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7251  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.53 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  0.687973 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0655  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.56 
 
 		 324 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2811  hydrogenase expression/formation protein hypE  29.03 
 
 		 351 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.116639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.36 
 
 		 334 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0725  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.97 
 
 		 347 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3018  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.38 
 
 		 336 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.35 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6175  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.69 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0950087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3203  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.93 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1761  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.76 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1043  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.56 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.606873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.96 
 
 		 349 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  27.12 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.09 
 
 		 352 aa  76.6  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  30.04 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.8 
 
 		 334 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1670  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.03 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2855  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.04 
 
 		 336 aa  76.3  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.431476 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.94 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02580  carbamoyl phosphate phosphatase, hydrogenase 3 maturation protein  27.7 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0959  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.7 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0982  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.7 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02545  hypothetical protein  27.7 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>