57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0148 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0148  AIR synthase-like protein  100 
 
 
332 aa  673    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  26.87 
 
 
331 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  26.25 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  29.29 
 
 
325 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  23.88 
 
 
327 aa  103  5e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  25 
 
 
348 aa  96.7  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  22.26 
 
 
341 aa  81.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  23.35 
 
 
335 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  21.82 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  23.42 
 
 
323 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  23.87 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  24.54 
 
 
337 aa  77.8  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  22.71 
 
 
326 aa  76.6  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  24.6 
 
 
304 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  20.95 
 
 
528 aa  66.6  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  22.27 
 
 
345 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.16 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.16 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.16 
 
 
342 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  18.94 
 
 
335 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  23.57 
 
 
326 aa  57.4  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  27.74 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  23.56 
 
 
318 aa  56.2  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  29.47 
 
 
357 aa  52.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3443  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.16 
 
 
349 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.233193  normal  0.767401 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3112  hydrogenase expression/formation protein HypE  21.72 
 
 
351 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  28.42 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  29.47 
 
 
359 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  20 
 
 
340 aa  50.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1540  hydrogenase expression/formation protein HypE  20.78 
 
 
349 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000883886  normal  0.111823 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  20.49 
 
 
337 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.92 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.92 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0538  putative hydrogenase expression/formation protein HypE  19.63 
 
 
348 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.92 
 
 
355 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  21.7 
 
 
367 aa  49.3  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.19 
 
 
349 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  20.2 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0881  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.76 
 
 
390 aa  48.9  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.74 
 
 
351 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  20.87 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  20.72 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4510  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.09 
 
 
337 aa  47  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.554082  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3758  hydrogenase expression/formation protein HypE  19.78 
 
 
348 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  21.54 
 
 
353 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  23.33 
 
 
338 aa  45.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.1 
 
 
772 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  21.75 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  21.75 
 
 
348 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  19.7 
 
 
348 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  20 
 
 
330 aa  44.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2404  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.53 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  29.55 
 
 
345 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3211  hydrogenase expression/formation protein HypE  35.94 
 
 
349 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  20.9 
 
 
347 aa  42.7  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.65 
 
 
768 aa  42.7  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.48 
 
 
761 aa  42.7  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>