More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0146 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0146  AIR synthase-like protein  100 
 
 
335 aa  658    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.592011  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0137  AIR synthase-like protein  71.17 
 
 
326 aa  448  1e-125  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.073197 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  69.54 
 
 
323 aa  433  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  69.57 
 
 
304 aa  420  1e-116  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  45.51 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1057  AIR synthase related protein domain protein  43.9 
 
 
330 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2909  AIR synthase related protein domain protein  44.65 
 
 
326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  42.66 
 
 
337 aa  230  3e-59  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  38.55 
 
 
348 aa  222  8e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  42.81 
 
 
330 aa  215  9e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  38.54 
 
 
327 aa  211  1e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  34.04 
 
 
331 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  35.93 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0697  AIR synthase related protein-like  36.53 
 
 
528 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000561591  hitchhiker  0.000000203748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  37.46 
 
 
345 aa  175  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  33.54 
 
 
325 aa  175  8e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1127  AIR synthase related protein  36.78 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  35.02 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2063  AIR synthase-like protein  41.42 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.216375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  33.63 
 
 
345 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  37.89 
 
 
335 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  30.61 
 
 
359 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  30.03 
 
 
357 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  30.61 
 
 
357 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0391  AIR synthase related protein domain protein  35.42 
 
 
340 aa  143  4e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.271366  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  33.43 
 
 
346 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  29.38 
 
 
341 aa  129  6e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1281  AIR synthase related protein domain protein  32.74 
 
 
345 aa  129  9.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  27.54 
 
 
332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3795  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.01 
 
 
352 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717086  normal  0.875312 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0975  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.69 
 
 
352 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.905159  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0465  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.65 
 
 
337 aa  105  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.512312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.08 
 
 
336 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3129  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.26 
 
 
336 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0363  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.85 
 
 
340 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1133  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.94 
 
 
336 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1953  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.23 
 
 
336 aa  99.8  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.76 
 
 
325 aa  98.6  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1077  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.37 
 
 
336 aa  97.4  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.26154  normal  0.1511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3686  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.96 
 
 
348 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.69 
 
 
345 aa  96.7  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.02 
 
 
331 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.45 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2277  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.29 
 
 
341 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  32.88 
 
 
323 aa  94.4  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.12 
 
 
334 aa  94  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0309  hydrogenase expression/formation protein HypE  30 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0480  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.85 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.367213  normal  0.144611 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.45 
 
 
334 aa  92.8  7e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2536  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.33 
 
 
352 aa  92.8  8e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0116  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.33 
 
 
349 aa  92.8  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.197928  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1164  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.94 
 
 
352 aa  92.4  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.03 
 
 
330 aa  92  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.87 
 
 
337 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.55 
 
 
328 aa  92  1e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0797  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.82 
 
 
368 aa  91.7  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.10297  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.8 
 
 
334 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3750  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.8 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2656  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.96 
 
 
341 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4015  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.17 
 
 
336 aa  89.7  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.734576  normal  0.167537 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50440  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.92 
 
 
341 aa  89.4  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.081583  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2090  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.71 
 
 
339 aa  89  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.71 
 
 
348 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  30.24 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1868  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.35 
 
 
339 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.71 
 
 
348 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
NC_002936  DET1435  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.43 
 
 
335 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00442446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1217  hydrogenase maturation factor  30.22 
 
 
335 aa  88.6  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.578228  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0556  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.42 
 
 
344 aa  88.6  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1756  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.09 
 
 
336 aa  87.8  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0473  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.06 
 
 
366 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.8639  normal  0.610083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4606  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.65 
 
 
367 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1782  hydrogenase expression/formation protein HypE  33.6 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.075887  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.09 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1813  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.99 
 
 
339 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2164  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.99 
 
 
339 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.432245  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1178  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.62 
 
 
348 aa  86.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.668048  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0140  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.86 
 
 
333 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00214828  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.47 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1880  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.15 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1912  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.15 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0436639  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1402  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.71 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.759509  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2024  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.64 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1905  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.15 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4100  hydrogenase expression/formation protein HypE  32.81 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3982  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.71 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.390338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1833  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.09 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1170  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.02 
 
 
348 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0475  hydrogenase maturation  31.1 
 
 
356 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.254195 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4556  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.13 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3879  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.89 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.18841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2414  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.99 
 
 
338 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108195 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2112  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.64 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0674973  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1899  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.09 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371927 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2014  hydrogenase expression/formation protein HypE  29.9 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0800  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.21 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.835937  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2391  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.65 
 
 
352 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.96 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  29 
 
 
351 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2449  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.82 
 
 
351 aa  82.4  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.027326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>