More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1952 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1952  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
734 aa  1442    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.31 
 
 
758 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.06 
 
 
733 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.46 
 
 
733 aa  538  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.8 
 
 
744 aa  535  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.42 
 
 
739 aa  530  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.15 
 
 
733 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.14 
 
 
730 aa  527  1e-148  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.17 
 
 
742 aa  525  1e-147  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.48 
 
 
742 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  48.42 
 
 
727 aa  522  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.56 
 
 
741 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.05 
 
 
754 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4765  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.44 
 
 
792 aa  525  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.89 
 
 
767 aa  520  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  520  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.22 
 
 
739 aa  520  1e-146  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.03 
 
 
739 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.56 
 
 
739 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.94 
 
 
739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0159  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
849 aa  518  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.08 
 
 
739 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.12 
 
 
733 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.06 
 
 
759 aa  509  1e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.55 
 
 
765 aa  510  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.66 
 
 
758 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.31 
 
 
768 aa  511  1e-143  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.62 
 
 
761 aa  508  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.89 
 
 
759 aa  507  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.56 
 
 
751 aa  505  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.72 
 
 
769 aa  503  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.62 
 
 
759 aa  503  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.8 
 
 
807 aa  503  1e-141  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.47 
 
 
755 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.83 
 
 
754 aa  505  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.27 
 
 
781 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.49 
 
 
775 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.64 
 
 
764 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.78 
 
 
764 aa  498  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.12 
 
 
737 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.74 
 
 
737 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.29 
 
 
765 aa  499  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.66 
 
 
767 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.21 
 
 
752 aa  496  1e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.23 
 
 
787 aa  498  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.52 
 
 
824 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.52 
 
 
767 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.52 
 
 
736 aa  494  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.76 
 
 
761 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.35 
 
 
724 aa  494  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.05 
 
 
766 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.94 
 
 
737 aa  492  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.13 
 
 
740 aa  489  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0822  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.75 
 
 
752 aa  491  1e-137  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.62 
 
 
764 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.46 
 
 
728 aa  489  1e-137  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.6 
 
 
728 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.43 
 
 
777 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.6 
 
 
777 aa  486  1e-136  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.2 
 
 
761 aa  486  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.99 
 
 
728 aa  486  1e-136  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.58 
 
 
746 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.67 
 
 
735 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.95 
 
 
768 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.17 
 
 
752 aa  483  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.09 
 
 
768 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.43 
 
 
739 aa  485  1e-135  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.54 
 
 
802 aa  485  1e-135  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.95 
 
 
768 aa  485  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.13 
 
 
751 aa  485  1e-135  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.28 
 
 
772 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.79 
 
 
741 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.5 
 
 
741 aa  479  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.6 
 
 
725 aa  481  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.99 
 
 
798 aa  481  1e-134  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.28 
 
 
719 aa  476  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.23 
 
 
768 aa  477  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.06 
 
 
741 aa  478  1e-133  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.6 
 
 
749 aa  474  1e-132  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.58 
 
 
774 aa  473  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.62 
 
 
739 aa  475  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.49 
 
 
723 aa  473  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.08 
 
 
729 aa  472  1e-132  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.79 
 
 
737 aa  476  1e-132  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.19 
 
 
794 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.46 
 
 
723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.71 
 
 
740 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.43 
 
 
730 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.14 
 
 
769 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2920  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.53 
 
 
799 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0505784  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 
741 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.45 
 
 
738 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.47 
 
 
772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.73 
 
 
719 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.8 
 
 
731 aa  471  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.63 
 
 
758 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>