More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4765 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.32 
 
 
769 aa  932    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.97 
 
 
764 aa  974    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.21 
 
 
739 aa  640    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.74 
 
 
742 aa  663    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.16 
 
 
764 aa  1013    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  638    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  637    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.2 
 
 
767 aa  671    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.58 
 
 
758 aa  936    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.1 
 
 
765 aa  1016    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.24 
 
 
755 aa  962    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.86 
 
 
772 aa  999    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23510  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.66 
 
 
775 aa  931    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.66266  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.61 
 
 
752 aa  1009    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34760  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  64.72 
 
 
774 aa  936    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767974  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.39 
 
 
754 aa  999    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.41 
 
 
773 aa  950    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.818593  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.37 
 
 
759 aa  656    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.68 
 
 
742 aa  662    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0159  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.21 
 
 
849 aa  900    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036919 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.27 
 
 
739 aa  638    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  638    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.35 
 
 
769 aa  931    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.25 
 
 
768 aa  935    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.76 
 
 
768 aa  978    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.22 
 
 
733 aa  655    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.34 
 
 
759 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.38 
 
 
761 aa  927    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.88 
 
 
774 aa  952    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4765  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
792 aa  1583    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  639    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.91 
 
 
824 aa  877    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.72 
 
 
807 aa  965    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  640    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  638    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.1 
 
 
758 aa  939    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2920  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.94 
 
 
799 aa  964    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0505784  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.76 
 
 
759 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.76 
 
 
768 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
739 aa  639    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.64 
 
 
761 aa  1019    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.68 
 
 
787 aa  985    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.02 
 
 
775 aa  960    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.32 
 
 
781 aa  960    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.25 
 
 
733 aa  637    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  66.49 
 
 
765 aa  1001    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.19 
 
 
733 aa  653    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.38 
 
 
798 aa  931    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.66 
 
 
772 aa  946    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.86 
 
 
754 aa  992    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.07 
 
 
751 aa  988    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.21 
 
 
758 aa  1023    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.28 
 
 
751 aa  1046    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.76 
 
 
768 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.94 
 
 
739 aa  635  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.33 
 
 
758 aa  633  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.53 
 
 
739 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.31 
 
 
741 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.04 
 
 
733 aa  629  1e-179  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.7 
 
 
737 aa  630  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.01 
 
 
768 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.34 
 
 
735 aa  614  9.999999999999999e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.99 
 
 
724 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.63 
 
 
761 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  47.27 
 
 
727 aa  612  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.59 
 
 
739 aa  605  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.91 
 
 
730 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.65 
 
 
744 aa  603  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.49 
 
 
740 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.49 
 
 
740 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.29 
 
 
737 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.2 
 
 
737 aa  602  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.54 
 
 
737 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.42 
 
 
740 aa  601  1e-170  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.28 
 
 
761 aa  596  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.5 
 
 
741 aa  597  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.41 
 
 
737 aa  597  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
740 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.37 
 
 
744 aa  593  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.53 
 
 
761 aa  589  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.28 
 
 
719 aa  592  1e-167  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.18 
 
 
735 aa  591  1e-167  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.86 
 
 
747 aa  588  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.14 
 
 
739 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.81 
 
 
761 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.63 
 
 
744 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.63 
 
 
743 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.55 
 
 
760 aa  583  1.0000000000000001e-165  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.88 
 
 
737 aa  579  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.96 
 
 
749 aa  582  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.87 
 
 
736 aa  579  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.23 
 
 
752 aa  580  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43 
 
 
729 aa  578  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 
745 aa  577  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.89 
 
 
741 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.34 
 
 
760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.33 
 
 
728 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.31 
 
 
728 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.19 
 
 
728 aa  572  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.67 
 
 
758 aa  569  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>