More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2256 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.74 
 
 		 719 aa  806    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.45 
 
 		 729 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.64 
 
 		 741 aa  882    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.86 
 
 		 736 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.08 
 
 		 732 aa  656    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.93 
 
 		 740 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.38 
 
 		 758 aa  642    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.07 
 
 		 729 aa  662    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.67 
 
 		 767 aa  783    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  695    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.55 
 
 		 749 aa  821    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.78 
 
 		 743 aa  818    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.31 
 
 		 740 aa  872    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.11 
 
 		 733 aa  670    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  695    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  694    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.74 
 
 		 739 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.25 
 
 		 737 aa  896    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.33 
 
 		 737 aa  865    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.97 
 
 		 739 aa  700    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.37 
 
 		 739 aa  699    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.01 
 
 		 760 aa  638    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.65 
 
 		 735 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.92 
 
 		 737 aa  854    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.3 
 
 		 777 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.52 
 
 		 729 aa  663    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.63 
 
 		 746 aa  821    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.21 
 
 		 741 aa  874    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.81 
 
 		 761 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.55 
 
 		 761 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.84 
 
 		 744 aa  670    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.75 
 
 		 723 aa  829    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.47 
 
 		 739 aa  894    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  695    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.23 
 
 		 737 aa  728    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.97 
 
 		 744 aa  838    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.78 
 
 		 740 aa  915    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.4 
 
 		 733 aa  673    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.36 
 
 		 759 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.06 
 
 		 737 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.84 
 
 		 736 aa  862    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 719 aa  1477    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.35 
 
 		 737 aa  865    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.23 
 
 		 758 aa  638    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.9 
 
 		 740 aa  864    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.88 
 
 		 719 aa  780    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.28 
 
 		 764 aa  636    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.62 
 
 		 736 aa  865    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.7 
 
 		 727 aa  919    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.51 
 
 		 742 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.68 
 
 		 736 aa  871    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.47 
 
 		 744 aa  873    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.36 
 
 		 768 aa  671    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.23 
 
 		 721 aa  750    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  72.03 
 
 		 747 aa  1043    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.08 
 
 		 743 aa  841    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  49.51 
 
 		 727 aa  642    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.71 
 
 		 741 aa  719    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.65 
 
 		 744 aa  862    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.34 
 
 		 742 aa  718    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.93 
 
 		 733 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.67 
 
 		 730 aa  648    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.31 
 
 		 740 aa  872    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.52 
 
 		 741 aa  880    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.7 
 
 		 745 aa  830    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.22 
 
 		 739 aa  654    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.29 
 
 		 759 aa  763    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.63 
 
 		 736 aa  848    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.45 
 
 		 729 aa  667    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.57 
 
 		 759 aa  783    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.07 
 
 		 741 aa  874    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.51 
 
 		 731 aa  656    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.74 
 
 		 760 aa  643    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.36 
 
 		 723 aa  805    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.97 
 
 		 739 aa  699    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.73 
 
 		 761 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.48 
 
 		 741 aa  877    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.15 
 
 		 739 aa  696    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.91 
 
 		 733 aa  741    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.22 
 
 		 735 aa  876    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.08 
 
 		 739 aa  693    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.15 
 
 		 761 aa  702    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.49 
 
 		 737 aa  830    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74.34 
 
 		 724 aa  1092    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.62 
 
 		 725 aa  634  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.07 
 
 		 770 aa  634  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.58 
 
 		 728 aa  629  1e-179  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.28 
 
 		 746 aa  628  1e-178  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.26 
 
 		 728 aa  627  1e-178  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.26 
 
 		 728 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.31 
 
 		 750 aa  615  1e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.44 
 
 		 767 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.79 
 
 		 775 aa  614  9.999999999999999e-175  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.73 
 
 		 802 aa  609  1e-173  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.02 
 
 		 754 aa  610  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.31 
 
 		 738 aa  612  1e-173  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.57 
 
 		 736 aa  612  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.68 
 
 		 741 aa  606  9.999999999999999e-173  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.44 
 
 		 767 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>