More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0028 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
739 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.55 
 
 
739 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.07 
 
 
739 aa  639    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.49 
 
 
739 aa  643    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
739 aa  640    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
739 aa  639    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.28 
 
 
739 aa  644    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.39 
 
 
742 aa  665    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.43 
 
 
767 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.38 
 
 
759 aa  660    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.87 
 
 
733 aa  654    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
739 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.44 
 
 
742 aa  671    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 
739 aa  640    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.23 
 
 
737 aa  653    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.15 
 
 
733 aa  661    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.38 
 
 
759 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.52 
 
 
733 aa  656    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.05 
 
 
739 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.2 
 
 
730 aa  645    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.51 
 
 
759 aa  650    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.79 
 
 
768 aa  665    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.92 
 
 
730 aa  667    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
752 aa  1526    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.36 
 
 
741 aa  642    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.05 
 
 
739 aa  635    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.91 
 
 
764 aa  639    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.91 
 
 
739 aa  648    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.95 
 
 
767 aa  628  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.02 
 
 
777 aa  627  1e-178  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.88 
 
 
777 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.9 
 
 
725 aa  622  1e-177  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  46.83 
 
 
727 aa  623  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.82 
 
 
767 aa  624  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.32 
 
 
729 aa  619  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.49 
 
 
740 aa  619  1e-176  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.04 
 
 
733 aa  619  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.03 
 
 
731 aa  621  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.16 
 
 
732 aa  620  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.61 
 
 
744 aa  615  1e-175  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.53 
 
 
719 aa  616  1e-175  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.37 
 
 
761 aa  615  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.95 
 
 
728 aa  616  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.54 
 
 
728 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.69 
 
 
728 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.59 
 
 
761 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.05 
 
 
751 aa  614  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.5 
 
 
747 aa  610  1e-173  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  45.61 
 
 
765 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.39 
 
 
723 aa  605  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.74 
 
 
729 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.29 
 
 
729 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.29 
 
 
729 aa  607  9.999999999999999e-173  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.94 
 
 
751 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.47 
 
 
737 aa  606  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.97 
 
 
724 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.79 
 
 
802 aa  603  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.65 
 
 
760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.86 
 
 
719 aa  604  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.19 
 
 
770 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.06 
 
 
760 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.07 
 
 
737 aa  602  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.22 
 
 
744 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.37 
 
 
737 aa  600  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.74 
 
 
740 aa  598  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.41 
 
 
749 aa  598  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.52 
 
 
761 aa  598  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.24 
 
 
758 aa  597  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.31 
 
 
775 aa  598  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.74 
 
 
740 aa  598  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.28 
 
 
741 aa  593  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.52 
 
 
765 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.5 
 
 
764 aa  593  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.5 
 
 
739 aa  595  1e-168  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.27 
 
 
736 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.02 
 
 
741 aa  595  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.73 
 
 
719 aa  595  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.75 
 
 
744 aa  592  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.64 
 
 
740 aa  594  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.73 
 
 
735 aa  590  1e-167  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.46 
 
 
740 aa  591  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.33 
 
 
746 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.21 
 
 
758 aa  590  1e-167  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.53 
 
 
743 aa  592  1e-167  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.08 
 
 
787 aa  590  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.08 
 
 
754 aa  590  1e-167  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.13 
 
 
782 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.62 
 
 
761 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.01 
 
 
741 aa  587  1e-166  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.03 
 
 
736 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.31 
 
 
735 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.86 
 
 
779 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.01 
 
 
741 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.49 
 
 
736 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.56 
 
 
779 aa  584  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46 
 
 
736 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.04 
 
 
744 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.32 
 
 
746 aa  582  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.58 
 
 
761 aa  585  1.0000000000000001e-165  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.92 
 
 
736 aa  583  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>