More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3107 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
773 aa  1551    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.818593  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.12 
 
 
824 aa  839    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.31 
 
 
787 aa  908    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.45 
 
 
754 aa  964    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4765  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.67 
 
 
792 aa  951    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.23 
 
 
765 aa  952    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.39 
 
 
761 aa  942    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2920  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  77.1 
 
 
799 aa  1185    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0505784  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.58 
 
 
768 aa  1009    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  80.13 
 
 
774 aa  1216    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.1 
 
 
758 aa  897    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0159  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.97 
 
 
849 aa  863    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00036919 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.17 
 
 
761 aa  851    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.07 
 
 
772 aa  1049    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  63.38 
 
 
765 aa  941    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.24 
 
 
775 aa  1137    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.28 
 
 
755 aa  945    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.07 
 
 
751 aa  934    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.94 
 
 
768 aa  953    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23510  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  73.3 
 
 
775 aa  1100    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.66266  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.97 
 
 
769 aa  1032    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.97 
 
 
758 aa  941    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69 
 
 
798 aa  1008    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.45 
 
 
772 aa  1028    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.84 
 
 
764 aa  925    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34760  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  82.44 
 
 
774 aa  1250    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767974  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.46 
 
 
752 aa  938    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.09 
 
 
754 aa  913    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.14 
 
 
758 aa  880    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.11 
 
 
769 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.42 
 
 
807 aa  924    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.45 
 
 
751 aa  988    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.39 
 
 
781 aa  957    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.94 
 
 
768 aa  953    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.94 
 
 
768 aa  953    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.25 
 
 
764 aa  972    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.29 
 
 
759 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.42 
 
 
759 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.91 
 
 
767 aa  625  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.1 
 
 
768 aa  622  1e-177  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.52 
 
 
742 aa  620  1e-176  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.09 
 
 
742 aa  617  1e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.03 
 
 
759 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.9 
 
 
744 aa  616  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.91 
 
 
737 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.77 
 
 
733 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.65 
 
 
739 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.51 
 
 
741 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.52 
 
 
739 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.54 
 
 
739 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.67 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.22 
 
 
733 aa  602  1.0000000000000001e-171  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.52 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.99 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
739 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
739 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.42 
 
 
737 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.46 
 
 
739 aa  602  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.5 
 
 
733 aa  601  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.05 
 
 
737 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.84 
 
 
749 aa  596  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.12 
 
 
744 aa  598  1e-169  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.44 
 
 
735 aa  598  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.7 
 
 
747 aa  594  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  47.23 
 
 
727 aa  592  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.78 
 
 
739 aa  590  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
740 aa  587  1e-166  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.59 
 
 
740 aa  587  1e-166  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.23 
 
 
761 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.84 
 
 
761 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.84 
 
 
724 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.2 
 
 
740 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.46 
 
 
733 aa  580  1e-164  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.75 
 
 
741 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.75 
 
 
741 aa  582  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.75 
 
 
741 aa  582  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.84 
 
 
727 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.56 
 
 
758 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.22 
 
 
735 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.84 
 
 
750 aa  576  1.0000000000000001e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.41 
 
 
737 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.8 
 
 
758 aa  569  1e-161  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.93 
 
 
741 aa  572  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.64 
 
 
737 aa  566  1e-160  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.28 
 
 
740 aa  566  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.78 
 
 
723 aa  565  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.31 
 
 
761 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.01 
 
 
736 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.05 
 
 
764 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.02 
 
 
737 aa  563  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.73 
 
 
740 aa  558  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.61 
 
 
741 aa  562  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.78 
 
 
777 aa  560  1e-158  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.24 
 
 
777 aa  562  1e-158  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.27 
 
 
736 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.55 
 
 
760 aa  560  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.78 
 
 
767 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>