More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37980 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.36 
 
 		 742 aa  657    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4068  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.62 
 
 		 772 aa  1011    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.72 
 
 		 758 aa  957    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6876  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  80.5 
 
 		 752 aa  1243    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.16 
 
 		 765 aa  970    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74.58 
 
 		 807 aa  1164    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  75.79 
 
 		 754 aa  1166    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.88 
 
 		 751 aa  939    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.92 
 
 		 769 aa  966    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34760  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  63.71 
 
 		 774 aa  937    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0767974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.63 
 
 		 798 aa  912    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0152  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.54 
 
 		 824 aa  901    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02500  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.27 
 
 		 768 aa  991    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.21 
 
 		 764 aa  966    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.59 
 
 		 733 aa  659    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.83 
 
 		 733 aa  642    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4417  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.11 
 
 		 761 aa  994    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.39231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3545  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.72 
 
 		 775 aa  931    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.746167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.23 
 
 		 758 aa  976    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23510  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.58 
 
 		 775 aa  920    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.66266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.41 
 
 		 787 aa  988    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0937  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.78 
 
 		 758 aa  1154    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  62.86 
 
 		 765 aa  931    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4546  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.25 
 
 		 768 aa  1168    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2364  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.44 
 
 		 774 aa  932    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.393156  normal  0.137182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.31 
 
 		 769 aa  962    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3592  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  74.17 
 
 		 755 aa  1132    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0159  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.19 
 
 		 849 aa  934    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.76 
 
 		 742 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 761 aa  1545    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0504799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4929  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.12 
 
 		 768 aa  1164    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.14 
 
 		 772 aa  959    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  73.08 
 
 		 781 aa  1147    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.51 
 
 		 754 aa  959    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4765  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.64 
 
 		 792 aa  984    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2920  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.74 
 
 		 799 aa  952    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0505784  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.28 
 
 		 751 aa  1011    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3107  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.39 
 
 		 773 aa  909    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.818593  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4633  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.25 
 
 		 768 aa  1168    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  75.49 
 
 		 764 aa  1173    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.252255  normal  0.661259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.44 
 
 		 767 aa  629  1e-179  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.05 
 
 		 733 aa  625  1e-177  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.98 
 
 		 741 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.74 
 
 		 739 aa  622  1e-177  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.81 
 
 		 759 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.38 
 
 		 759 aa  617  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.24 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.39 
 
 		 758 aa  616  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  617  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 739 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.13 
 
 		 739 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.81 
 
 		 759 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.76 
 
 		 737 aa  612  1e-173  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.49 
 
 		 733 aa  608  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.99 
 
 		 737 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.16 
 
 		 744 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.68 
 
 		 739 aa  599  1e-170  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  47.14 
 
 		 727 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.3 
 
 		 739 aa  600  1e-170  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.76 
 
 		 736 aa  597  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.58 
 
 		 740 aa  598  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.82 
 
 		 761 aa  598  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.89 
 
 		 737 aa  593  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.47 
 
 		 724 aa  593  1e-168  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.65 
 
 		 758 aa  595  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.44 
 
 		 741 aa  595  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.87 
 
 		 744 aa  589  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.27 
 
 		 761 aa  588  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.86 
 
 		 730 aa  587  1e-166  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.83 
 
 		 737 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.29 
 
 		 767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.78 
 
 		 747 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.62 
 
 		 767 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.22 
 
 		 761 aa  580  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.79 
 
 		 802 aa  581  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.61 
 
 		 764 aa  581  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.78 
 
 		 735 aa  579  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.25 
 
 		 760 aa  579  1e-164  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.03 
 
 		 741 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.92 
 
 		 752 aa  576  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.45 
 
 		 777 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.85 
 
 		 741 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.92 
 
 		 761 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.91 
 
 		 749 aa  578  1.0000000000000001e-163  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.5 
 
 		 729 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.15 
 
 		 760 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.71 
 
 		 741 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.55 
 
 		 727 aa  569  1e-161  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.52 
 
 		 741 aa  571  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.26 
 
 		 740 aa  571  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.24 
 
 		 770 aa  570  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.76 
 
 		 737 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.03 
 
 		 750 aa  569  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.2 
 
 		 740 aa  568  1e-160  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>