More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3119 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.45 
 
 
724 aa  901    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.49 
 
 
733 aa  673    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1505  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  64.81 
 
 
743 aa  937    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.244217 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.44 
 
 
740 aa  963    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
736 aa  1487    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  71.37 
 
 
737 aa  1063    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.21 
 
 
736 aa  999    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.92 
 
 
745 aa  924    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.27 
 
 
741 aa  1005    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.9 
 
 
737 aa  821    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.08 
 
 
737 aa  1003    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.23 
 
 
746 aa  850    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.81 
 
 
719 aa  845    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.51 
 
 
723 aa  835    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.16 
 
 
740 aa  958    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.82 
 
 
737 aa  659    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.21 
 
 
740 aa  902    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.55 
 
 
733 aa  663    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.27 
 
 
761 aa  706    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.58 
 
 
759 aa  737    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.65 
 
 
733 aa  665    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.35 
 
 
736 aa  1007    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.63 
 
 
719 aa  861    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.79 
 
 
719 aa  782    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.98 
 
 
736 aa  1043    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.64 
 
 
759 aa  752    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.2 
 
 
736 aa  1030    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.99 
 
 
744 aa  1025    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.65 
 
 
743 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.2 
 
 
768 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.72 
 
 
721 aa  804    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  59.95 
 
 
747 aa  863    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  76.2 
 
 
735 aa  1138    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.62 
 
 
744 aa  983    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.66 
 
 
727 aa  846    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.96 
 
 
744 aa  663    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.71 
 
 
742 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.53 
 
 
735 aa  1061    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  62.09 
 
 
740 aa  848    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.57 
 
 
741 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  66.44 
 
 
740 aa  963    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  58.49 
 
 
741 aa  846    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  67.63 
 
 
739 aa  996    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.61 
 
 
733 aa  653    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.13 
 
 
741 aa  1005    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  57.2 
 
 
737 aa  823    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.05 
 
 
741 aa  1014    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.64 
 
 
759 aa  736    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  68.23 
 
 
749 aa  999    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  60.94 
 
 
723 aa  833    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  70.82 
 
 
737 aa  1056    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.26 
 
 
742 aa  654    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.37 
 
 
741 aa  1018    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.9 
 
 
767 aa  740    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  61.24 
 
 
737 aa  919    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  63.65 
 
 
744 aa  923    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.89 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.41 
 
 
751 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.89 
 
 
739 aa  632  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.03 
 
 
739 aa  634  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.61 
 
 
729 aa  630  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  629  1e-179  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.45 
 
 
739 aa  629  1e-179  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.03 
 
 
739 aa  630  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 
739 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.54 
 
 
758 aa  627  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.05 
 
 
731 aa  622  1e-176  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.41 
 
 
732 aa  618  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.73 
 
 
764 aa  613  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  44.85 
 
 
765 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.8 
 
 
760 aa  612  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.89 
 
 
770 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.71 
 
 
730 aa  611  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.25 
 
 
736 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  47.71 
 
 
727 aa  609  1e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.81 
 
 
761 aa  610  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.62 
 
 
728 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.33 
 
 
728 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.55 
 
 
777 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.78 
 
 
761 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.86 
 
 
761 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.22 
 
 
760 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.21 
 
 
728 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.97 
 
 
758 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.27 
 
 
725 aa  596  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.23 
 
 
767 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.85 
 
 
739 aa  596  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.93 
 
 
758 aa  595  1e-169  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.38 
 
 
729 aa  595  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5410  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.93 
 
 
764 aa  595  1e-168  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539592  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.75 
 
 
765 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.39 
 
 
758 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.26 
 
 
777 aa  593  1e-168  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.44 
 
 
769 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.36 
 
 
767 aa  592  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.2 
 
 
729 aa  589  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>