More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0064 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.92 
 
 
741 aa  744    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.15 
 
 
761 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 
730 aa  690    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.25 
 
 
759 aa  701    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  708    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 
739 aa  706    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.47 
 
 
802 aa  695    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.03 
 
 
794 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.41 
 
 
742 aa  698    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  708    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  707    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.21 
 
 
739 aa  703    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.13 
 
 
737 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.99 
 
 
741 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.78 
 
 
736 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
744 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.93 
 
 
803 aa  653    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.86 
 
 
764 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.9 
 
 
743 aa  763    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.9 
 
 
777 aa  728    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.07 
 
 
766 aa  646    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.21 
 
 
739 aa  705    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  708    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.08 
 
 
777 aa  709    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.3 
 
 
733 aa  725    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.25 
 
 
759 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.01 
 
 
734 aa  764    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.28 
 
 
719 aa  636    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.55 
 
 
739 aa  711    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.05 
 
 
782 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  708    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.91 
 
 
733 aa  728    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
746 aa  1505    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.21 
 
 
739 aa  706    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.39 
 
 
759 aa  683    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  51.6 
 
 
727 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.94 
 
 
775 aa  714    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.71 
 
 
739 aa  663    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.7 
 
 
738 aa  645    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.18 
 
 
767 aa  730    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.71 
 
 
803 aa  657    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.58 
 
 
724 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.71 
 
 
750 aa  640    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.99 
 
 
767 aa  699    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.79 
 
 
760 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.34 
 
 
739 aa  708    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.48 
 
 
758 aa  694    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.39 
 
 
742 aa  699    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.32 
 
 
767 aa  726    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.17 
 
 
733 aa  687    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.63 
 
 
758 aa  635  1e-180  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.49 
 
 
761 aa  632  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.23 
 
 
779 aa  633  1e-180  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.13 
 
 
768 aa  629  1e-179  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.35 
 
 
779 aa  630  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.97 
 
 
761 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.1 
 
 
741 aa  631  1e-179  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.79 
 
 
754 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.58 
 
 
760 aa  631  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.28 
 
 
779 aa  632  1e-179  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.28 
 
 
779 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.1 
 
 
740 aa  626  1e-178  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.73 
 
 
741 aa  624  1e-177  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.42 
 
 
735 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.62 
 
 
761 aa  624  1e-177  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.12 
 
 
739 aa  625  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.73 
 
 
741 aa  624  1e-177  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.65 
 
 
770 aa  624  1e-177  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.86 
 
 
737 aa  624  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.04 
 
 
741 aa  621  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.18 
 
 
727 aa  616  1e-175  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.3 
 
 
733 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.51 
 
 
749 aa  614  9.999999999999999e-175  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.02 
 
 
747 aa  614  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.36 
 
 
804 aa  615  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.91 
 
 
741 aa  608  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.8 
 
 
768 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.15 
 
 
735 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.71 
 
 
729 aa  599  1e-170  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.42 
 
 
740 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.42 
 
 
740 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.97 
 
 
729 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.59 
 
 
744 aa  600  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.97 
 
 
729 aa  600  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.83 
 
 
737 aa  596  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.29 
 
 
740 aa  598  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.97 
 
 
744 aa  597  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.29 
 
 
737 aa  594  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.49 
 
 
743 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.68 
 
 
737 aa  595  1e-168  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.74 
 
 
742 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.28 
 
 
727 aa  588  1e-166  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.64 
 
 
745 aa  588  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.92 
 
 
736 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.65 
 
 
736 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.12 
 
 
728 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.14 
 
 
744 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.15 
 
 
736 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.32 
 
 
752 aa  580  1e-164  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.93 
 
 
729 aa  580  1e-164  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>