More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0836 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  684    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  53.44 
 
 		 325 aa  328  1.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  47.06 
 
 		 326 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  41.82 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  43.87 
 
 		 323 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  42.94 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  46.88 
 
 		 331 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  41.12 
 
 		 327 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  42.37 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  41.59 
 
 		 334 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  40.18 
 
 		 328 aa  227  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  40.41 
 
 		 342 aa  223  4e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  40.55 
 
 		 331 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  40.82 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  40.44 
 
 		 341 aa  212  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  40.25 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  31.45 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  28.17 
 
 		 331 aa  168  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  31.1 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  31.08 
 
 		 326 aa  162  9e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  31.85 
 
 		 330 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  32.92 
 
 		 336 aa  159  5e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  27.24 
 
 		 324 aa  155  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  33.7 
 
 		 338 aa  155  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  27.95 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  27.02 
 
 		 327 aa  150  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  27.47 
 
 		 323 aa  149  8e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  30.58 
 
 		 323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  28.12 
 
 		 331 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  38.84 
 
 		 479 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  37.61 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.82 
 
 		 481 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  32.71 
 
 		 471 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  29 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  33.48 
 
 		 323 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  32.31 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  24.67 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  27.72 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  28.67 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  33.57 
 
 		 328 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  33.48 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  30.58 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  32.06 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  35.34 
 
 		 341 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0646  thiamine-monophosphate kinase  30.7 
 
 		 334 aa  63.9  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.82 
 
 		 731 aa  63.2  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1162  selenophosphate synthetase  27.31 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.268491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  31.25 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  29.92 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  32.86 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  26.4 
 
 		 348 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  31.25 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  29.51 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2521  thiamine-phosphate kinase (thiamin-monophosphate kinase)  25.56 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  29.29 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  28.11 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  25.16 
 
 		 344 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  28.11 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  28.11 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0895  thiamine-monophosphate kinase  36.81 
 
 		 324 aa  60.1  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0369638  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  29.41 
 
 		 345 aa  60.1  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  27.33 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3537  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.8 
 
 		 738 aa  58.9  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  33.8 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  30.41 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.34 
 
 		 741 aa  58.9  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  24.39 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  26.52 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  33.77 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  28.44 
 
 		 359 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  31.65 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  28.69 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0742475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  28.29 
 
 		 347 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.79 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  30.24 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  25 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0014  thiamine-monophosphate kinase  24.55 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  29.03 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0823  selenophosphate synthetase  30.24 
 
 		 344 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.285598  normal  0.0506627 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  28.98 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.19 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0850  selenophosphate synthetase  30.24 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2567  thiamine monophosphate kinase  36.15 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.39 
 
 		 717 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.59 
 
 		 985 aa  56.6  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0168341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  34.35 
 
 		 339 aa  56.6  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  28.57 
 
 		 353 aa  56.2  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  29.1 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0592  thiamine-monophosphate kinase  30.14 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1693  thiamine-monophosphate kinase  33.33 
 
 		 340 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0213115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0536  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.06 
 
 		 715 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.87 
 
 		 730 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  29.35 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  33.09 
 
 		 334 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0213  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.12 
 
 		 973 aa  55.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  29.13 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  31.05 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  27.75 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  27.73 
 
 		 304 aa  54.7  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>