279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3475 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  100 
 
 		 342 aa  680    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2101  AIR synthase related protein  74.29 
 
 		 341 aa  474  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.183279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0558  AIR synthase related protein  72.78 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  62.66 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  63.29 
 
 		 327 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  61.68 
 
 		 328 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5396  AIR synthase related protein  59.63 
 
 		 331 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0059  AIR synthase related protein  60.19 
 
 		 331 aa  355  5e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.148611  normal  0.181031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0248  AIR synthase related protein  59.56 
 
 		 331 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.484423  normal  0.676888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1995  AIR synthase related protein  57.76 
 
 		 323 aa  331  8e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  54.27 
 
 		 328 aa  330  2e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  54.55 
 
 		 328 aa  325  1e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  53.25 
 
 		 334 aa  285  5.999999999999999e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  44.44 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  35.96 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  41.45 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1267  AIR synthase related protein  34.06 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  34.57 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0832  AIR synthase-like protein  37.14 
 
 		 336 aa  189  5e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.786385  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0496  AIR synthase related protein  32.1 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1750  methanogenesis marker protein 2  34.8 
 
 		 330 aa  179  8e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0779  AIR synthase related protein  33.02 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.278492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  32.93 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0044  AIR synthase related protein  33.02 
 
 		 327 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  36.28 
 
 		 321 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1139  methanogenesis marker protein 2  32.41 
 
 		 327 aa  172  9e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0844  AIR synthase related protein  33.12 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223576  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1073  AIR synthase related protein  32.93 
 
 		 338 aa  167  2e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.145823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  34.06 
 
 		 333 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 479 aa  136  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  39.37 
 
 		 486 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  34.7 
 
 		 481 aa  134  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1220  GCN5-related N-acetyltransferase  34.3 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104607 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1021  thiamine-phosphate kinase  27.21 
 
 		 333 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0674633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1157  thiamine-monophosphate kinase  32.47 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2017  thiamine-monophosphate kinase  29.33 
 
 		 337 aa  73.2  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3194  thiamine monophosphate kinase  27.49 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3155  thiamine-monophosphate kinase  28.48 
 
 		 323 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000840757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0605  thiamine-monophosphate kinase  26.62 
 
 		 323 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.655619  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1216  thiamine-monophosphate kinase  28.8 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000120227  normal  0.180356 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3153  thiamine-monophosphate kinase  28.48 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000108532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  29.67 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0619  thiamine-monophosphate kinase  25.17 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  5.18956e-35 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  29.08 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3298  thiamine-monophosphate kinase  28.38 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000889615  decreased coverage  0.000117497 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2773  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00271748  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0605  thiamine-monophosphate kinase  25.43 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.926757  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1167  thiamine-monophosphate kinase  27.18 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0557102  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.15 
 
 		 717 aa  63.2  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1149  thiamine-monophosphate kinase  24.48 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.017464  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.86 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155289  normal  0.489485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3400  thiamine monophosphate kinase  26.98 
 
 		 332 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0357932 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0432  thiamine-monophosphate kinase  28.2 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0313115  normal  0.821004 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1192  thiamine-monophosphate kinase  27.97 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0510899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  26.22 
 
 		 329 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3047  thiamine monophosphate kinase  29.65 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5192  thiamine-monophosphate kinase  33.57 
 
 		 339 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3464  thiamin-monophosphate kinase  26.21 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  35.17 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1101  thiamine-monophosphate kinase  26.86 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285593  normal  0.797182 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.71 
 
 		 731 aa  60.8  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.95 
 
 		 716 aa  60.5  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  29.71 
 
 		 351 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2605  thiamine monophosphate kinase  25.8 
 
 		 331 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807884  normal  0.0305329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1278  thiamine-phosphate kinase  27.3 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000168907  unclonable  0.0000000000863796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1040  thiamine-monophosphate kinase  26.53 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000743717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2848  thiamine monophosphate kinase  26.94 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0556  thiamine monophosphate kinase  26.14 
 
 		 334 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1167  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00022874  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  25.68 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4694  thiamine-monophosphate kinase  27.6 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  0.226637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0791  thiamine-monophosphate kinase  29.37 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0583  thiamine-monophosphate kinase  30.36 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  23.21 
 
 		 325 aa  57  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1387  thiamine-monophosphate kinase  25.74 
 
 		 319 aa  57  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0324994  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2602  thiamine-monophosphate kinase  26.14 
 
 		 333 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0259397  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2006  thiamine-monophosphate kinase  32.85 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.55 
 
 		 599 aa  56.2  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0581  thiamine-monophosphate kinase  23.93 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.384161  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  29.79 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2283  thiamine-monophosphate kinase  35.71 
 
 		 341 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.127979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0147  thiamine monophosphate kinase  29.11 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1455  thiamine-monophosphate kinase  27.66 
 
 		 327 aa  55.8  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0630  thiamine monophosphate kinase  29.11 
 
 		 332 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  26.44 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1576  thiamine-monophosphate kinase  23.93 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000735175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2889  thiamine-monophosphate kinase  21.93 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000202219  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0637  thiamine monophosphate kinase  30.41 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.216101 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1928  thiamine-monophosphate kinase  31.36 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0598  thiamine monophosphate kinase  28.69 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.516909  normal  0.343428 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0531  thiamine monophosphate kinase  28.77 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1597  thiamine-phosphate kinase  26.9 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4047  thiamine-monophosphate kinase  25.35 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0258  thiamine-monophosphate kinase  25.16 
 
 		 355 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.451362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0555  thiamine monophosphate kinase  28.62 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3440  thiamine monophosphate kinase  28.03 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.721251  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1027  thiamine-monophosphate kinase  31.03 
 
 		 344 aa  53.9  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0548176  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2478  thiamine monophosphate kinase  28.03 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.152794  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3475  thiamine monophosphate kinase  28.03 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3477  thiamine monophosphate kinase  28.03 
 
 		 333 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.695085  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>