More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1236 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_1525  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.83 
 
 
601 aa  810    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1236  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
590 aa  1201    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1574  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  65.83 
 
 
601 aa  811    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1097  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  69.87 
 
 
599 aa  832    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000033132  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  42.54 
 
 
727 aa  417  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.5 
 
 
758 aa  414  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.63 
 
 
733 aa  405  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.5 
 
 
733 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.63 
 
 
742 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.76 
 
 
729 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.86 
 
 
739 aa  395  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.56 
 
 
729 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.56 
 
 
729 aa  390  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.19 
 
 
742 aa  392  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.4 
 
 
758 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1959  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.18 
 
 
727 aa  383  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0119456  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.72 
 
 
741 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.39 
 
 
744 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  382  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.61 
 
 
739 aa  383  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  381  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  382  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.34 
 
 
739 aa  379  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  381  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  382  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.18 
 
 
761 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.51 
 
 
739 aa  381  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.34 
 
 
739 aa  380  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0634  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.93 
 
 
716 aa  379  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.191388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.87 
 
 
730 aa  375  1e-103  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38 
 
 
739 aa  378  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.6 
 
 
761 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.42 
 
 
733 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.97 
 
 
752 aa  374  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.29 
 
 
741 aa  374  1e-102  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.59 
 
 
761 aa  370  1e-101  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.01 
 
 
746 aa  370  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.65 
 
 
738 aa  372  1e-101  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.69 
 
 
760 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1539  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.89 
 
 
717 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.93 
 
 
760 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.45 
 
 
770 aa  365  1e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.93 
 
 
764 aa  364  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.86 
 
 
743 aa  363  4e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.57 
 
 
750 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.31 
 
 
768 aa  363  6e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40.97 
 
 
712 aa  362  9e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0822  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  40 
 
 
752 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.18 
 
 
742 aa  359  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.73 
 
 
777 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.48 
 
 
734 aa  358  1.9999999999999998e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.46 
 
 
736 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3537  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.48 
 
 
738 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.27 
 
 
754 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.29 
 
 
802 aa  356  5e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.79 
 
 
767 aa  357  5e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.01 
 
 
779 aa  355  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.67 
 
 
779 aa  355  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.91 
 
 
759 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.27 
 
 
759 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.43 
 
 
779 aa  353  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.97 
 
 
765 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39.09 
 
 
759 aa  353  5.9999999999999994e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.69 
 
 
767 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.65 
 
 
751 aa  350  5e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.03 
 
 
775 aa  349  6e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.28 
 
 
777 aa  348  1e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  39 
 
 
724 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.56 
 
 
758 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.79 
 
 
779 aa  348  2e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.494756  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.76 
 
 
732 aa  348  2e-94  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0540  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.13 
 
 
772 aa  346  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.9 
 
 
731 aa  345  1e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.66 
 
 
741 aa  345  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.35 
 
 
730 aa  344  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0678  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.68 
 
 
769 aa  343  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.35 
 
 
803 aa  343  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  38.03 
 
 
765 aa  343  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.21 
 
 
803 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.75 
 
 
751 aa  342  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.42 
 
 
733 aa  341  2e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.35 
 
 
767 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.82 
 
 
804 aa  340  5.9999999999999996e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.79 
 
 
723 aa  338  9.999999999999999e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.43 
 
 
719 aa  338  9.999999999999999e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0761  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.99 
 
 
709 aa  339  9.999999999999999e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.36787  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6405  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.4 
 
 
758 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.773242  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.32 
 
 
782 aa  336  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.63 
 
 
766 aa  336  7e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.79 
 
 
749 aa  334  2e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.98 
 
 
754 aa  335  2e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.86 
 
 
761 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1459  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.93 
 
 
732 aa  333  4e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10818  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  35.69 
 
 
754 aa  333  5e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0131091  normal  0.548571 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05940  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.89 
 
 
798 aa  333  7.000000000000001e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1952  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  36.84 
 
 
734 aa  333  7.000000000000001e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  38.76 
 
 
794 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.92 
 
 
737 aa  332  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  37.59 
 
 
723 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>