More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0654 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 		 729 aa  1494    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  796    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.53 
 
 		 739 aa  799    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  795    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  798    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.4 
 
 		 739 aa  796    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.35 
 
 		 742 aa  818    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.91 
 
 		 744 aa  684    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  795    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.15 
 
 		 740 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48 
 
 		 733 aa  664    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  795    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.07 
 
 		 719 aa  673    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.06 
 
 		 749 aa  651    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.73 
 
 		 739 aa  800    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.66 
 
 		 767 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.37 
 
 		 727 aa  651    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.46 
 
 		 723 aa  640    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.13 
 
 		 739 aa  794    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.65 
 
 		 742 aa  820    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.86 
 
 		 747 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.26 
 
 		 739 aa  796    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  48.18 
 
 		 727 aa  641    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  87.52 
 
 		 729 aa  1311    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.53 
 
 		 742 aa  699    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.3 
 
 		 733 aa  690    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.45 
 
 		 724 aa  678    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.48 
 
 		 741 aa  651    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.32 
 
 		 739 aa  754    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.15 
 
 		 741 aa  690    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  51.32 
 
 		 738 aa  702    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3455  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.66 
 
 		 737 aa  649    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.821031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  87.52 
 
 		 729 aa  1311    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.9 
 
 		 733 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.99 
 
 		 739 aa  792    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.66 
 
 		 741 aa  710    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.41 
 
 		 733 aa  655    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.77 
 
 		 761 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.88 
 
 		 759 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.79 
 
 		 737 aa  634  1e-180  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.09 
 
 		 758 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.87 
 
 		 719 aa  631  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.89 
 
 		 731 aa  629  1e-179  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.17 
 
 		 730 aa  627  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.01 
 
 		 737 aa  628  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.41 
 
 		 767 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.8 
 
 		 737 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3971  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.12 
 
 		 723 aa  628  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 		 759 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.28 
 
 		 767 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 		 759 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.26 
 
 		 736 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.78 
 
 		 735 aa  622  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47 
 
 		 739 aa  623  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.35 
 
 		 728 aa  621  1e-176  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.64 
 
 		 777 aa  621  1e-176  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.21 
 
 		 761 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.93 
 
 		 736 aa  621  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.29 
 
 		 760 aa  619  1e-176  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0185  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.75 
 
 		 737 aa  621  1e-176  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.310724 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.05 
 
 		 728 aa  619  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.95 
 
 		 740 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.24 
 
 		 761 aa  616  1e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.67 
 
 		 758 aa  616  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.64 
 
 		 761 aa  615  1e-175  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.6 
 
 		 736 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.2 
 
 		 728 aa  617  1e-175  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1786  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.19 
 
 		 736 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0011  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.89 
 
 		 741 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.95 
 
 		 746 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.11 
 
 		 729 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.01 
 
 		 768 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.64 
 
 		 764 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0012  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.89 
 
 		 741 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.76 
 
 		 736 aa  612  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.59 
 
 		 725 aa  608  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.11 
 
 		 743 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.83 
 
 		 777 aa  605  9.999999999999999e-173  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50 
 
 		 719 aa  607  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.01 
 
 		 744 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.206882  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.31 
 
 		 744 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.64 
 
 		 770 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.9 
 
 		 737 aa  607  9.999999999999999e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.53 
 
 		 736 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1308  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.8 
 
 		 737 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.68 
 
 		 732 aa  602  1.0000000000000001e-171  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.15 
 
 		 802 aa  605  1.0000000000000001e-171  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.74 
 
 		 752 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1127  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.37 
 
 		 741 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.38 
 
 		 740 aa  598  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.31 
 
 		 735 aa  601  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.71 
 
 		 746 aa  599  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.21 
 
 		 760 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.15 
 
 		 741 aa  600  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.38 
 
 		 740 aa  598  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.98 
 
 		 775 aa  596  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.92 
 
 		 766 aa  592  1e-168  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.34 
 
 		 740 aa  595  1e-168  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.76 
 
 		 745 aa  591  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.5 
 
 		 779 aa  592  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>