More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0140 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_0275  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  54.89 
 
 
739 aa  820    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0654  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.53 
 
 
729 aa  691    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4362  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.66 
 
 
767 aa  647    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516732  normal  0.595476 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0323  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.03 
 
 
739 aa  823    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0281  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.3 
 
 
739 aa  826    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0266  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.3 
 
 
739 aa  823    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0269  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.3 
 
 
739 aa  825    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0340  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.27 
 
 
739 aa  820    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.84 
 
 
739 aa  830    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22130  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.59 
 
 
733 aa  685    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.759305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0294  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.3 
 
 
739 aa  826    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0397  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.99 
 
 
744 aa  671    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2048  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.73 
 
 
733 aa  713    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.156991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4214  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.71 
 
 
759 aa  644    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.317587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4980  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.27 
 
 
739 aa  820    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2366  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  50.4 
 
 
741 aa  712    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4346  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.32 
 
 
759 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0491496  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0259  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.97 
 
 
742 aa  856    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0367  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.03 
 
 
739 aa  823    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1129  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.73 
 
 
729 aa  693    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  56.51 
 
 
739 aa  853    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1133  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  52.65 
 
 
741 aa  774    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  53.65 
 
 
738 aa  797    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.3 
 
 
739 aa  826    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1151  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.73 
 
 
729 aa  693    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1135  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  55.71 
 
 
742 aa  829    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.78 
 
 
733 aa  678    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.68 
 
 
730 aa  646    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1450  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.33 
 
 
733 aa  647    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00244925  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4369  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.32 
 
 
759 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0179  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.44 
 
 
758 aa  644    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0140  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  100 
 
 
742 aa  1542    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1089  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.78 
 
 
761 aa  634  1e-180  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.550447  normal  0.288584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  47.32 
 
 
737 aa  629  1e-179  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1273  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.83 
 
 
761 aa  630  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1019  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.01 
 
 
761 aa  621  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  49.28 
 
 
758 aa  619  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1310  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.63 
 
 
760 aa  617  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.831791  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1265  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.69 
 
 
760 aa  615  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.377491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0996  phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit II  45.8 
 
 
727 aa  613  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3742  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 
767 aa  614  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182155 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3840  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.87 
 
 
761 aa  611  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.619159  normal  0.165254 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1205  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  48.26 
 
 
770 aa  611  1e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.737255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3688  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.16 
 
 
767 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.88 
 
 
777 aa  603  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.400519  normal  0.10064 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4321  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.94 
 
 
764 aa  605  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4622  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.54 
 
 
768 aa  595  1e-169  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409731  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1835  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.73 
 
 
729 aa  593  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1015  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.26 
 
 
736 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3970  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.84 
 
 
724 aa  591  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0786403 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0826  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.68 
 
 
728 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0978  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.28 
 
 
728 aa  588  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.74135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8978  Phosphoribosylformylglycinamidine synthase  43.45 
 
 
765 aa  588  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1035  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.85 
 
 
728 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.88 
 
 
766 aa  587  1e-166  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1663  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.69 
 
 
750 aa  586  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0547  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.45 
 
 
725 aa  585  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0667  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.4 
 
 
732 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.629797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2256  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46 
 
 
719 aa  585  1.0000000000000001e-165  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.49 
 
 
747 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.25 
 
 
737 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1027  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.4 
 
 
741 aa  585  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.352422 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0556  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.55 
 
 
731 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.624203  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3339  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.21 
 
 
751 aa  580  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3636  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.76 
 
 
777 aa  580  1e-164  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.900704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0008  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.38 
 
 
737 aa  579  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.70389  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0064  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.74 
 
 
746 aa  580  1e-164  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.250893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.75 
 
 
775 aa  581  1e-164  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0513067 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3394  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.12 
 
 
802 aa  579  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1330  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.28 
 
 
803 aa  577  1.0000000000000001e-163  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0003  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.35 
 
 
768 aa  578  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2298  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.11 
 
 
734 aa  576  1.0000000000000001e-163  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.032092 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3119  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.78 
 
 
736 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.89 
 
 
727 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.29 
 
 
737 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2274  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.11 
 
 
754 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00429114  normal  0.210249 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0028  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.63 
 
 
752 aa  570  1e-161  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.68 
 
 
740 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3587  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.16 
 
 
782 aa  567  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.565249 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0155  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.76 
 
 
769 aa  565  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.513467  normal  0.0402011 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.8 
 
 
739 aa  566  1e-160  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.37 
 
 
754 aa  566  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.91 
 
 
803 aa  567  1e-160  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.63 
 
 
723 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  46.59 
 
 
745 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.37 
 
 
735 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0312  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.11 
 
 
758 aa  560  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1053  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.62 
 
 
743 aa  559  1e-158  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.207294 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.95 
 
 
740 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4090  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.04 
 
 
749 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919609  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.09 
 
 
740 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0158  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41 
 
 
765 aa  555  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  45.35 
 
 
743 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1184  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  43.51 
 
 
735 aa  558  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.09 
 
 
740 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.52 
 
 
779 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00021  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  41.4 
 
 
804 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.327511  hitchhiker  0.00549488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.8 
 
 
746 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0291  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  42.38 
 
 
787 aa  552  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  44.78 
 
 
744 aa  555  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>