202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1227 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0826  AIR synthase related protein  73.3 
 
 
441 aa  654    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0488292  normal  0.413402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  100 
 
 
442 aa  875    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  72.89 
 
 
443 aa  629  1e-179  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  66.51 
 
 
438 aa  557  1e-157  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  61.14 
 
 
439 aa  541  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  55.86 
 
 
444 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  57.34 
 
 
440 aa  490  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  57.24 
 
 
456 aa  471  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1302  AIR synthase related protein  51.44 
 
 
448 aa  437  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  51.44 
 
 
447 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1382  AIR synthase related protein  51.22 
 
 
447 aa  425  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0662  AIR synthase-like protein  51.22 
 
 
447 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.758214  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  51.35 
 
 
450 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2149  AIR synthase-like protein  41.48 
 
 
425 aa  311  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000105335  hitchhiker  0.000422525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  38.43 
 
 
432 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  25.83 
 
 
339 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  33.16 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.36 
 
 
334 aa  67  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  28.8 
 
 
331 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  25.89 
 
 
338 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.97 
 
 
334 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  30.84 
 
 
326 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  27.19 
 
 
315 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.97 
 
 
334 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  29.2 
 
 
354 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1413  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.36 
 
 
331 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0720065  normal  0.131563 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.71 
 
 
339 aa  61.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  27.73 
 
 
355 aa  60.1  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  27.76 
 
 
335 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  29.02 
 
 
369 aa  58.9  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  31.11 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1613  hydrogenase expression/formation protein HypE  31.06 
 
 
353 aa  58.9  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.112161  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  28.77 
 
 
353 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  26.82 
 
 
347 aa  57.8  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  32.43 
 
 
316 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  27.31 
 
 
342 aa  57.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  31.58 
 
 
320 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  35 
 
 
343 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1243  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.47 
 
 
345 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  30.23 
 
 
317 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  29.65 
 
 
319 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  30.08 
 
 
343 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  31.91 
 
 
343 aa  56.6  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  25.6 
 
 
340 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  26.46 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  26.73 
 
 
348 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  27.24 
 
 
357 aa  55.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1286  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.24 
 
 
334 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  30.43 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  24.24 
 
 
335 aa  54.7  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  25.59 
 
 
730 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  29.53 
 
 
709 aa  54.3  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0465  AIR synthase related protein domain protein  27.21 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2949  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.72 
 
 
336 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.48771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  23.87 
 
 
345 aa  53.9  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  26.7 
 
 
767 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  29.17 
 
 
327 aa  53.5  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  25.82 
 
 
332 aa  53.5  0.000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  30.23 
 
 
357 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  30.23 
 
 
354 aa  53.5  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.68 
 
 
723 aa  53.1  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  25.85 
 
 
304 aa  53.1  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  29.05 
 
 
358 aa  53.1  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3965  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.45 
 
 
330 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  25.96 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  25.55 
 
 
359 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  27.64 
 
 
671 aa  52.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0368  thiamine-monophosphate kinase  26.87 
 
 
323 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  26.67 
 
 
328 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.79 
 
 
331 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.82 
 
 
351 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1093  thiamine-monophosphate kinase  24.8 
 
 
325 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.45 
 
 
331 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  27.85 
 
 
354 aa  51.6  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  29.3 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  29.3 
 
 
356 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  29.3 
 
 
354 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  23.29 
 
 
326 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  28.27 
 
 
347 aa  51.6  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  30.9 
 
 
359 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0151  selenophosphate synthetase  25.68 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.270141  normal  0.0151469 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3233  AIR synthase related protein domain protein  27.16 
 
 
346 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  28.33 
 
 
351 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1669  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.38 
 
 
334 aa  50.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0081  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.46 
 
 
693 aa  50.8  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.239309 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  24.58 
 
 
357 aa  50.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  27.69 
 
 
323 aa  50.8  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  28.07 
 
 
330 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  28.97 
 
 
385 aa  50.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  28.79 
 
 
327 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2499  AIR synthase related protein domain protein  29.55 
 
 
330 aa  50.1  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00696097  normal  0.39351 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  30.93 
 
 
351 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  24.76 
 
 
345 aa  49.7  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1568  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.21 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1751  selenophosphate synthetase  26.58 
 
 
347 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  28.84 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  29.55 
 
 
317 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  28.9 
 
 
351 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1979  thiamine-monophosphate kinase  29.94 
 
 
292 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  28.84 
 
 
356 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>