79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2149 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2149  AIR synthase-like protein  100 
 
 
425 aa  855    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000105335  hitchhiker  0.000422525 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  57.08 
 
 
432 aa  503  1e-141  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  41.72 
 
 
444 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1302  AIR synthase related protein  41.2 
 
 
448 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0826  AIR synthase related protein  41.36 
 
 
441 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0488292  normal  0.413402 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0662  AIR synthase-like protein  39.96 
 
 
447 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.758214  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  40.91 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  39.74 
 
 
447 aa  312  6.999999999999999e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  42.95 
 
 
438 aa  309  5e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1382  AIR synthase related protein  40.04 
 
 
447 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  39.46 
 
 
439 aa  305  7e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  40.55 
 
 
443 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  40.36 
 
 
450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  40.96 
 
 
456 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  41.48 
 
 
442 aa  297  2e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  25.63 
 
 
331 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  27.4 
 
 
335 aa  67  0.0000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  33.08 
 
 
325 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  25.1 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1820  thiamine-monophosphate kinase  28.45 
 
 
323 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.17 
 
 
339 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  25 
 
 
325 aa  57  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  36.54 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  26.62 
 
 
327 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0146  thiamine-monophosphate kinase  25.53 
 
 
339 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.134022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  36.84 
 
 
325 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1186  AIR synthase-like protein  25.2 
 
 
304 aa  54.3  0.000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  34.74 
 
 
312 aa  53.9  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  29.66 
 
 
332 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  31.58 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  23.34 
 
 
345 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2111  thiamine-monophosphate kinase  27.2 
 
 
317 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  0.178161 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  22.71 
 
 
332 aa  51.2  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  26.89 
 
 
323 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  24.82 
 
 
323 aa  50.4  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3011  thiamine-monophosphate kinase  26.58 
 
 
323 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3292  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.59 
 
 
342 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09190  thiamine-phosphate kinase  25.84 
 
 
322 aa  50.4  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.268775  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  29.66 
 
 
346 aa  50.1  0.00007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3071  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.59 
 
 
342 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.316451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3314  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.59 
 
 
342 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3213  thiamine-monophosphate kinase  26.71 
 
 
329 aa  50.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.330996  hitchhiker  0.00000000031057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  23.3 
 
 
327 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  27.38 
 
 
344 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  24.04 
 
 
347 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  27.52 
 
 
354 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4457  thiamine monophosphate kinase  24.84 
 
 
321 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  23.08 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  28.28 
 
 
341 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1476  AIR synthase domain protein  21.28 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332948  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  27.38 
 
 
344 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  28.69 
 
 
328 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  24.11 
 
 
335 aa  47.8  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.56 
 
 
334 aa  47.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.93 
 
 
334 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0640  AIR synthase related protein domain protein  26.18 
 
 
371 aa  47  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.221872  normal  0.692624 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2640  thiamine-monophosphate kinase  23.43 
 
 
323 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23047  normal  0.216691 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  28.97 
 
 
341 aa  46.6  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1068  thiamine-monophosphate kinase  26.04 
 
 
304 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.794513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0163  thiamine-monophosphate kinase  22 
 
 
338 aa  46.2  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.959025  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2677  thiamine-monophosphate kinase  23.11 
 
 
323 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00408376  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  21.97 
 
 
340 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0960  AIR synthase-like protein  33.33 
 
 
337 aa  45.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.2 
 
 
334 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0788  hydrogenase expression/formation protein HypE  19.64 
 
 
336 aa  44.7  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.571655  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1592  AIR synthase domain-containing protein  21.51 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0242218  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  24.04 
 
 
320 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.62 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3320  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.48 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  23.64 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  26.96 
 
 
479 aa  44.3  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2797  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.48 
 
 
348 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.990811  normal  0.141163 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  23.85 
 
 
318 aa  44.3  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  23.32 
 
 
331 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0836  hypothetical protein  24.24 
 
 
338 aa  44.3  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.261675 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1340  AIR synthase-like protein  21.37 
 
 
357 aa  43.9  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0251507  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3978  thiamine-monophosphate kinase  34.04 
 
 
331 aa  43.5  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.142445  decreased coverage  0.00138187 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13161  hypothetical protein  22.33 
 
 
326 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.87 
 
 
351 aa  43.1  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>