51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1056 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1056  AIR synthase related protein  100 
 
 
432 aa  861    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0908596  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2149  AIR synthase-like protein  57.08 
 
 
425 aa  503  1e-141  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000105335  hitchhiker  0.000422525 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3475  hypothetical protein  40.86 
 
 
444 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0243076 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1060  AIR synthase related protein  39.95 
 
 
439 aa  309  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.130176  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1302  AIR synthase related protein  41.76 
 
 
448 aa  309  6.999999999999999e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0826  AIR synthase related protein  41.41 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0488292  normal  0.413402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1227  AIR synthase related protein  40.29 
 
 
442 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0894  AIR synthase related protein  42.76 
 
 
450 aa  299  5e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1382  AIR synthase related protein  40.27 
 
 
447 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1294  AIR synthase-like protein  40.22 
 
 
447 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1407  AIR synthase related protein  39.18 
 
 
456 aa  297  3e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0662  AIR synthase-like protein  39.78 
 
 
447 aa  296  4e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.758214  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0846  cell division GTPase-like protein  40.35 
 
 
438 aa  294  2e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1879  AIR synthase related protein domain protein  38.32 
 
 
443 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1802  AIR synthase related protein  38.69 
 
 
440 aa  293  4e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0522  AIR synthase related protein domain protein  25.47 
 
 
341 aa  63.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.298857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3356  thiamine-monophosphate kinase  30.46 
 
 
325 aa  60.1  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1820  AIR synthase-like protein  23.94 
 
 
331 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.79718  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0955  AIR synthase-like protein  26.28 
 
 
332 aa  58.9  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0129734  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0476  thiamine-phosphate kinase  25.56 
 
 
312 aa  56.6  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3160  thiamine-monophosphate kinase  30.77 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.172815  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3484  thiamine-monophosphate kinase  30 
 
 
325 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1035  thiamin-monophosphate kinase  26.4 
 
 
340 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.44 
 
 
339 aa  49.7  0.00009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0812  thiamine-monophosphate kinase  30.33 
 
 
346 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1457  AIR synthase related protein domain protein  27.18 
 
 
325 aa  49.3  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00681323  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2179  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.65 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.486425 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1667  AIR synthase-like protein  20.71 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2120  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.65 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0569732  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2133  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.65 
 
 
355 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.871781  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2128  thiamine-monophosphate kinase  26.01 
 
 
331 aa  49.7  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000222353  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  24.64 
 
 
330 aa  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2006  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.76 
 
 
335 aa  47.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1721  thiamine-monophosphate kinase  24.64 
 
 
323 aa  47  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.488772  normal  0.0257709 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3633  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.11 
 
 
330 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0117  AIR synthase-like protein  22.11 
 
 
323 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.634114 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04400  putative thiamine-monophosphate kinase  23.3 
 
 
352 aa  46.6  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2839  thiamine monophosphate kinase  26.19 
 
 
344 aa  46.6  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1037  AIR synthase related protein domain protein  26.32 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3257  thiamine monophosphate kinase  26.19 
 
 
344 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117282  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1222  AIR synthase related protein domain protein  28.87 
 
 
345 aa  45.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0509225 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1693  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.45 
 
 
709 aa  45.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.708191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7541  thiamine-monophosphate kinase  26.16 
 
 
330 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.301752  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1936  AIR synthase related protein domain protein  19.93 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2317  thiamine monophosphate kinase  29.29 
 
 
332 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2596  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.5 
 
 
351 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.547599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6802  thiamine-monophosphate kinase  24.82 
 
 
328 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.826688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1244  thiamine-monophosphate kinase  23.08 
 
 
313 aa  43.5  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1874  thiamine-monophosphate kinase  23.08 
 
 
320 aa  43.1  0.009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4031  thiamine monophosphate kinase  28.28 
 
 
341 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0483109  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1420  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.78 
 
 
712 aa  43.1  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>