More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3350 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  53.74 
 
 		 717 aa  699    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  54.56 
 
 		 720 aa  679    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  100 
 
 		 709 aa  1392    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  40.03 
 
 		 765 aa  436  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  40.39 
 
 		 796 aa  413  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  36.87 
 
 		 767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  54.4 
 
 		 366 aa  346  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  53.57 
 
 		 366 aa  339  9e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  52.89 
 
 		 369 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  33.24 
 
 		 791 aa  282  2e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  34.09 
 
 		 675 aa  273  1e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  28.63 
 
 		 727 aa  255  3e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  33 
 
 		 675 aa  251  3e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  27.58 
 
 		 726 aa  248  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  27.41 
 
 		 726 aa  246  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.03 
 
 		 386 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.51 
 
 		 386 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  31.33 
 
 		 730 aa  244  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.29 
 
 		 379 aa  232  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  36.46 
 
 		 372 aa  223  9e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  24.97 
 
 		 722 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  36.69 
 
 		 394 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  25.1 
 
 		 723 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  25.94 
 
 		 723 aa  209  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  25.03 
 
 		 723 aa  205  3e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  37.67 
 
 		 402 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  40.75 
 
 		 379 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.11 
 
 		 374 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.43 
 
 		 374 aa  173  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.17 
 
 		 381 aa  171  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.65 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.71 
 
 		 364 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.6 
 
 		 366 aa  159  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  39.33 
 
 		 343 aa  158  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  32.45 
 
 		 354 aa  147  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  29.43 
 
 		 380 aa  147  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.35 
 
 		 369 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  35.45 
 
 		 347 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29 
 
 		 369 aa  145  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  32.24 
 
 		 342 aa  144  6e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  32.79 
 
 		 340 aa  144  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1198  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.98 
 
 		 367 aa  142  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209232  hitchhiker  0.00325073 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  37.92 
 
 		 345 aa  143  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  37.46 
 
 		 350 aa  141  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  33.99 
 
 		 337 aa  140  7e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.07 
 
 		 366 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  34.83 
 
 		 355 aa  140  8.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2262  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.87 
 
 		 370 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  32.32 
 
 		 344 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  36.93 
 
 		 389 aa  139  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2562  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.37 
 
 		 367 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.616641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  36.72 
 
 		 340 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  33.97 
 
 		 351 aa  137  9e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  36.02 
 
 		 360 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  36.13 
 
 		 355 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  34.19 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  37.18 
 
 		 349 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  35.92 
 
 		 316 aa  135  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  32.8 
 
 		 344 aa  135  3e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  38.29 
 
 		 351 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  35.95 
 
 		 357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  37.34 
 
 		 351 aa  134  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  36.02 
 
 		 326 aa  134  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  33.66 
 
 		 353 aa  134  6e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  37.92 
 
 		 314 aa  134  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  38.06 
 
 		 316 aa  133  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  35.14 
 
 		 346 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  34.74 
 
 		 357 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  35.44 
 
 		 319 aa  132  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  36.77 
 
 		 356 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  37.97 
 
 		 355 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  33.67 
 
 		 347 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3716  selenophosphate synthetase  37.54 
 
 		 351 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  31.07 
 
 		 343 aa  131  4.0000000000000003e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  36.77 
 
 		 356 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  33.67 
 
 		 347 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  32.28 
 
 		 354 aa  130  7.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  33.67 
 
 		 347 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  33.67 
 
 		 347 aa  130  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  35.93 
 
 		 321 aa  130  8.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  32.57 
 
 		 348 aa  130  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  35.71 
 
 		 328 aa  130  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  36.74 
 
 		 333 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  33.33 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  33.33 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  36.91 
 
 		 327 aa  129  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  37.59 
 
 		 317 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  37.22 
 
 		 351 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  33.33 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  32.25 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  31.07 
 
 		 343 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  35.81 
 
 		 328 aa  128  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  33 
 
 		 347 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  33.55 
 
 		 351 aa  128  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  30.84 
 
 		 358 aa  128  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  36.66 
 
 		 385 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  36.66 
 
 		 421 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  36.33 
 
 		 389 aa  127  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  34.96 
 
 		 343 aa  127  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>