More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4785 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  46.42 
 
 
765 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  100 
 
 
767 aa  1583    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  44.14 
 
 
796 aa  594  1e-168  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.87 
 
 
379 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 
386 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  52.88 
 
 
386 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  52.75 
 
 
394 aa  427  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  36.87 
 
 
709 aa  419  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  36.44 
 
 
720 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  36.98 
 
 
791 aa  402  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  34.77 
 
 
717 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  46.95 
 
 
372 aa  363  6e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  33.02 
 
 
675 aa  347  6e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  30.17 
 
 
726 aa  319  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  30.41 
 
 
726 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  31.1 
 
 
730 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  29.85 
 
 
727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  37.01 
 
 
675 aa  269  2e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  28.03 
 
 
722 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  26.29 
 
 
723 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  25.87 
 
 
723 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  38.13 
 
 
402 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  25.78 
 
 
723 aa  233  9e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  37.84 
 
 
369 aa  210  8e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  35.78 
 
 
342 aa  209  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  37.29 
 
 
354 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  37.16 
 
 
347 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  34.02 
 
 
340 aa  198  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.91 
 
 
374 aa  196  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  33.62 
 
 
351 aa  193  8e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  34.71 
 
 
354 aa  192  2.9999999999999997e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  38.33 
 
 
323 aa  192  2.9999999999999997e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  35.17 
 
 
348 aa  191  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  37.33 
 
 
328 aa  191  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
366 aa  190  8e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.67 
 
 
379 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  35.53 
 
 
343 aa  188  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.09 
 
 
366 aa  188  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  36.09 
 
 
309 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  33.84 
 
 
343 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  33.54 
 
 
343 aa  184  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  35.36 
 
 
351 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  34.83 
 
 
343 aa  182  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  35.1 
 
 
320 aa  181  4e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  34.64 
 
 
343 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  36.42 
 
 
318 aa  180  7e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  35.29 
 
 
315 aa  180  7e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  37.8 
 
 
326 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  39 
 
 
316 aa  180  1e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  37.38 
 
 
314 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  35.4 
 
 
316 aa  179  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  35.65 
 
 
355 aa  178  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  37.7 
 
 
345 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  32.22 
 
 
337 aa  177  5e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.16 
 
 
374 aa  177  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  37.62 
 
 
352 aa  176  1.9999999999999998e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1345  selenide, water dikinase  33.24 
 
 
354 aa  176  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  34.57 
 
 
350 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  37.46 
 
 
327 aa  175  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.54 
 
 
381 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  32.84 
 
 
353 aa  174  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.16 
 
 
366 aa  174  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  31.52 
 
 
358 aa  174  7.999999999999999e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  36.36 
 
 
340 aa  173  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  36.69 
 
 
317 aa  173  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  34.28 
 
 
328 aa  171  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  34.19 
 
 
325 aa  171  4e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  34.77 
 
 
320 aa  171  6e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  37.64 
 
 
317 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  33.62 
 
 
347 aa  170  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  33.62 
 
 
671 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  34.76 
 
 
350 aa  169  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  33.84 
 
 
344 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  32.76 
 
 
369 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  36.54 
 
 
348 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  36.54 
 
 
348 aa  169  2.9999999999999998e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1896  selenide, water dikinase  34.32 
 
 
362 aa  168  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  33.82 
 
 
356 aa  168  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  33.53 
 
 
356 aa  167  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  33.91 
 
 
358 aa  167  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  32.63 
 
 
359 aa  167  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  34.88 
 
 
347 aa  167  9e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  36.21 
 
 
348 aa  166  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  35.55 
 
 
347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  38.2 
 
 
319 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  33.71 
 
 
355 aa  165  4.0000000000000004e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  32.23 
 
 
359 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  34.11 
 
 
360 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  34.69 
 
 
308 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  33.13 
 
 
340 aa  164  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  35.55 
 
 
347 aa  164  7e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  35.55 
 
 
347 aa  164  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  35.55 
 
 
347 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  31.34 
 
 
389 aa  163  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  33.54 
 
 
343 aa  163  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  31.45 
 
 
357 aa  163  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  35.55 
 
 
347 aa  163  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  32.43 
 
 
346 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  35.22 
 
 
347 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  34.01 
 
 
351 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>