More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0214 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  100 
 
 
675 aa  1355    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  62.39 
 
 
675 aa  824    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  52.84 
 
 
730 aa  652    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  43.63 
 
 
726 aa  598  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  43.49 
 
 
726 aa  596  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  42.92 
 
 
727 aa  549  1e-155  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  37.71 
 
 
722 aa  505  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  36.73 
 
 
723 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  36.87 
 
 
723 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  36.17 
 
 
723 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  31.22 
 
 
796 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  36.68 
 
 
767 aa  276  9e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  31.68 
 
 
765 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  34.27 
 
 
709 aa  267  5e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  33.81 
 
 
720 aa  266  8e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  31.93 
 
 
717 aa  259  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.87 
 
 
386 aa  171  5e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  30.38 
 
 
791 aa  169  1e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.11 
 
 
386 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.9 
 
 
379 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.43 
 
 
379 aa  147  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  34.49 
 
 
369 aa  147  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.7 
 
 
366 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  33.44 
 
 
348 aa  143  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  30.51 
 
 
340 aa  141  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.42 
 
 
366 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  30.15 
 
 
394 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  31.1 
 
 
337 aa  141  3.9999999999999997e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  34.03 
 
 
323 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  37.38 
 
 
317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  29.48 
 
 
342 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  32.5 
 
 
347 aa  131  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.49 
 
 
364 aa  129  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  32.87 
 
 
320 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.24 
 
 
374 aa  128  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  35.71 
 
 
360 aa  126  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  31.01 
 
 
315 aa  126  1e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  31.97 
 
 
316 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  31.85 
 
 
378 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.19 
 
 
372 aa  125  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  32 
 
 
347 aa  124  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  32.53 
 
 
351 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  32.42 
 
 
343 aa  123  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  31.48 
 
 
354 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  32.87 
 
 
314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  33.22 
 
 
317 aa  122  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  30.89 
 
 
352 aa  122  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  32.78 
 
 
326 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  32.79 
 
 
343 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  34.06 
 
 
340 aa  120  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  32.67 
 
 
357 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  31.69 
 
 
356 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.59 
 
 
358 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  33.22 
 
 
355 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  27.16 
 
 
354 aa  119  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  32.37 
 
 
328 aa  119  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  29.13 
 
 
343 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  32.38 
 
 
356 aa  118  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  31.54 
 
 
320 aa  117  5e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  33.22 
 
 
358 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  30.51 
 
 
309 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  31.1 
 
 
351 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  33.02 
 
 
348 aa  114  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  32.53 
 
 
355 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  32.7 
 
 
348 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  32.7 
 
 
348 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  31.38 
 
 
340 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  33.45 
 
 
316 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  32.99 
 
 
291 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  28.39 
 
 
343 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  30.07 
 
 
344 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1198  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.6 
 
 
367 aa  111  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209232  hitchhiker  0.00325073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  35.38 
 
 
317 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  26.98 
 
 
380 aa  111  5e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  34.04 
 
 
318 aa  111  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1496  selenide, water dikinase  30.57 
 
 
308 aa  110  6e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.258981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  30.51 
 
 
345 aa  110  7.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1683  selenophosphate synthetase  32.38 
 
 
347 aa  110  9.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  31.53 
 
 
319 aa  110  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  29.27 
 
 
325 aa  109  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  33.55 
 
 
369 aa  109  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  31.43 
 
 
357 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  31.85 
 
 
671 aa  110  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  30.83 
 
 
344 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  31.23 
 
 
314 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  29.47 
 
 
402 aa  109  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  32.08 
 
 
327 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.79 
 
 
381 aa  109  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  32.43 
 
 
354 aa  109  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  31.49 
 
 
359 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  32.35 
 
 
297 aa  107  7e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  25.7 
 
 
358 aa  107  9e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  29.79 
 
 
328 aa  107  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  31.06 
 
 
348 aa  106  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  31.72 
 
 
351 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.06 
 
 
369 aa  105  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  31.54 
 
 
350 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0666  selenide, water dikinase  32.54 
 
 
350 aa  106  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2262  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.15 
 
 
370 aa  106  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  32.01 
 
 
349 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>