More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48952 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  100 
 
 
791 aa  1640    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  39.51 
 
 
796 aa  475  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  40.52 
 
 
765 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  36.34 
 
 
767 aa  403  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  33.24 
 
 
709 aa  290  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  31.66 
 
 
720 aa  287  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  29.21 
 
 
717 aa  249  1e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  26.28 
 
 
730 aa  223  9e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  26.97 
 
 
726 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.5 
 
 
379 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  25.96 
 
 
726 aa  213  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  34.82 
 
 
386 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.86 
 
 
386 aa  203  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  27.06 
 
 
675 aa  202  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  23.54 
 
 
727 aa  179  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  26.68 
 
 
675 aa  174  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  31.55 
 
 
394 aa  172  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  34.09 
 
 
340 aa  170  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  34.18 
 
 
348 aa  164  9e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  32.44 
 
 
402 aa  157  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  22.19 
 
 
722 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  31.98 
 
 
342 aa  157  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  32.86 
 
 
347 aa  152  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  35.92 
 
 
316 aa  152  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  34.77 
 
 
354 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  35.93 
 
 
291 aa  148  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  32.3 
 
 
357 aa  148  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  33.12 
 
 
320 aa  147  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  32.76 
 
 
352 aa  146  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  36.49 
 
 
318 aa  147  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  32.02 
 
 
357 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  31.56 
 
 
352 aa  147  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  32.02 
 
 
357 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  35.69 
 
 
327 aa  146  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  32.59 
 
 
344 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  31.74 
 
 
357 aa  146  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  32.02 
 
 
354 aa  146  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  34.64 
 
 
315 aa  145  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  33.53 
 
 
340 aa  145  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  34.31 
 
 
328 aa  144  4e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  30.84 
 
 
358 aa  145  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  31.28 
 
 
352 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  31.93 
 
 
354 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  31.93 
 
 
357 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  32.04 
 
 
354 aa  144  6e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  36.28 
 
 
350 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  31.28 
 
 
352 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  33.76 
 
 
314 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  33.76 
 
 
351 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  32.36 
 
 
369 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  31.01 
 
 
352 aa  142  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  29.91 
 
 
343 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  31.36 
 
 
352 aa  140  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  34.42 
 
 
309 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  32.75 
 
 
343 aa  139  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  31.36 
 
 
352 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  31.36 
 
 
352 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  29.34 
 
 
343 aa  139  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  31.91 
 
 
353 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  30.48 
 
 
369 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.92 
 
 
372 aa  138  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  34.85 
 
 
317 aa  138  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  30.9 
 
 
347 aa  138  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  31.43 
 
 
351 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  31.36 
 
 
389 aa  137  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  36.64 
 
 
343 aa  137  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  31.61 
 
 
354 aa  137  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  34.41 
 
 
355 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  22.11 
 
 
723 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3631  selenophosphate synthetase  29.77 
 
 
344 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.571871  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  34.88 
 
 
297 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  31.07 
 
 
352 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43280  selenophosphate synthetase  29.77 
 
 
344 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.823398 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  32.92 
 
 
359 aa  135  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  31.34 
 
 
358 aa  135  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  33.13 
 
 
319 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4627  selenophosphate synthetase  31.64 
 
 
353 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173949  normal  0.0779363 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1677  selenide, water dikinase  34.93 
 
 
340 aa  135  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.309519  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  30.77 
 
 
360 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  32.85 
 
 
351 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  35.37 
 
 
328 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2198  selenophosphate synthetase  31.76 
 
 
389 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1832  selenophosphate synthetase  31.99 
 
 
421 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  36.3 
 
 
343 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  32 
 
 
355 aa  134  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0405  selenophosphate synthetase  31.99 
 
 
385 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0503  selenophosphate synthetase  31.99 
 
 
356 aa  134  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  32.54 
 
 
344 aa  134  6.999999999999999e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  30.48 
 
 
346 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.91 
 
 
366 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  30.46 
 
 
357 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  29.83 
 
 
357 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  31.34 
 
 
349 aa  133  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  32.26 
 
 
316 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  30.81 
 
 
347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1473  selenophosphate synthetase  31.7 
 
 
354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10180  selenophosphate synthetase  30.36 
 
 
345 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  31.7 
 
 
356 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0819  selenophosphate synthetase  31.7 
 
 
354 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  34.58 
 
 
357 aa  132  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>