More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3386 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  100 
 
 
402 aa  805    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  45.09 
 
 
765 aa  287  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  42.67 
 
 
796 aa  283  5.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.96 
 
 
386 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.12 
 
 
374 aa  245  9e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.7 
 
 
386 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  35.49 
 
 
394 aa  239  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  38.13 
 
 
767 aa  238  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  35.56 
 
 
717 aa  228  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.1 
 
 
381 aa  226  4e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  38.26 
 
 
720 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.97 
 
 
379 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  37.67 
 
 
709 aa  222  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.61 
 
 
366 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  33.77 
 
 
372 aa  213  3.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  38.44 
 
 
369 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.8 
 
 
366 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.31 
 
 
374 aa  195  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.48 
 
 
366 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3556  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  35.23 
 
 
382 aa  173  5.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  32.89 
 
 
364 aa  169  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  32.98 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1198  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.67 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209232  hitchhiker  0.00325073 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  29.26 
 
 
380 aa  164  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2262  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.17 
 
 
370 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  32.44 
 
 
791 aa  157  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.1 
 
 
369 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  29.77 
 
 
730 aa  142  8e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1837  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.46 
 
 
369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2562  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  27.69 
 
 
367 aa  139  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.616641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.42 
 
 
366 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2327  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.41 
 
 
427 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.41 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0793  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  28.99 
 
 
371 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  30.61 
 
 
675 aa  133  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  27.37 
 
 
726 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  26.85 
 
 
726 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  28.68 
 
 
675 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1544  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.72 
 
 
358 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  25.77 
 
 
727 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  23.47 
 
 
722 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1953  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.65 
 
 
366 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1828  NADH dehydrogenase  29.62 
 
 
450 aa  102  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  hitchhiker  0.00233776 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5248  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.38 
 
 
452 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1512  NADH dehydrogenase  27.16 
 
 
445 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0765  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.1 
 
 
433 aa  101  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.01 
 
 
449 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.987451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3718  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.05 
 
 
444 aa  97.8  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1949  NADH dehydrogenase  27.78 
 
 
379 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2229  NADH dehydrogenase, membrane flavoprotein FAD NAD ubiquinone electron transport oxidoreductase  26.46 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4267  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.36 
 
 
452 aa  97.1  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2311  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.13 
 
 
444 aa  96.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.364819  hitchhiker  0.000890266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4164  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.73 
 
 
437 aa  96.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.754604  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2041  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.85 
 
 
444 aa  96.3  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0563919  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  23.36 
 
 
723 aa  95.9  1e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1888  NADH dehydrogenase  26.53 
 
 
439 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.635217  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4826  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.72 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0239032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2434  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.15 
 
 
444 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0942  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.51 
 
 
441 aa  94.7  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2958  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.81 
 
 
462 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4473  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.45 
 
 
437 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.618936  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5091  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.61 
 
 
452 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.524897 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4838  NADH dehydrogenase  25.77 
 
 
431 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3241  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.35 
 
 
452 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.621427 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0226  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.41 
 
 
391 aa  94  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4321  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.43 
 
 
452 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4539  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.01 
 
 
440 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.859142  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3517  NADH dehydrogenase  29.13 
 
 
429 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2168  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.84 
 
 
456 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  0.677345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58870  NADH dehydrogenase  25.45 
 
 
435 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0525175 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  23.36 
 
 
723 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3661  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.3 
 
 
398 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.165286 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2821  NADH dehydrogenase  28.91 
 
 
409 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0999  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.14 
 
 
430 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828499  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2984  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  27.14 
 
 
452 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5174  NADH dehydrogenase  25.76 
 
 
435 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2944  NADH dehydrogenase  27.2 
 
 
429 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.699684  normal  0.473905 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3026  NADH dehydrogenase  27.2 
 
 
429 aa  92  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.850506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3123  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.2 
 
 
429 aa  92  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.570794  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0160  NADH dehydrogenase  26.63 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.55146  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12000  uncoupled NADH:quinone oxidoreductase  26.6 
 
 
432 aa  91.3  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1294  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.93 
 
 
436 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.746503  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0874  NADH dehydrogenase  26.82 
 
 
444 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.357726  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2623  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.56 
 
 
467 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154931  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5003  NADH dehydrogenase  27.43 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5857  NADH dehydrogenase  27.43 
 
 
452 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  23.62 
 
 
723 aa  89.7  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2710  NADH dehydrogenase  26.3 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000265247  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0936  NADH dehydrogenase  26.47 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.151731  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3654  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.29 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.141344  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1070  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.86 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0642  NADH dehydrogenase  27.17 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2846  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.69 
 
 
451 aa  89  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.368376  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4492  NADH dehydrogenase  26.29 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3414  NADH dehydrogenase  26.53 
 
 
433 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2878  NADH dehydrogenase  27.01 
 
 
428 aa  88.2  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.96993  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3873  NADH dehydrogenase  26.29 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4420  NADH dehydrogenase  26.42 
 
 
448 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0675814  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0908  NADH dehydrogenase  20.44 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4266  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.8 
 
 
401 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.701794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>