More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1667 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  98.21 
 
 		 726 aa  1439    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  100 
 
 		 726 aa  1466    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  45.22 
 
 		 730 aa  675    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  45.49 
 
 		 727 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  43.93 
 
 		 675 aa  593  1e-168  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  43.35 
 
 		 675 aa  557  1e-157  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  40.3 
 
 		 722 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  38.68 
 
 		 723 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  38.8 
 
 		 723 aa  488  1e-136  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  38.47 
 
 		 723 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  29.92 
 
 		 767 aa  285  2.0000000000000002e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  27.96 
 
 		 765 aa  273  7e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  28.88 
 
 		 720 aa  265  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  26.35 
 
 		 796 aa  254  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  27.41 
 
 		 709 aa  237  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  26.9 
 
 		 717 aa  224  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  26.97 
 
 		 791 aa  200  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.84 
 
 		 379 aa  153  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  31.25 
 
 		 386 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  30.15 
 
 		 386 aa  152  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.81 
 
 		 366 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.73 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  30.38 
 
 		 369 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.22 
 
 		 379 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2705  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.42 
 
 		 374 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.410059 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  29.13 
 
 		 342 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  29.69 
 
 		 337 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  28.88 
 
 		 340 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4965  ankyrin  27.71 
 
 		 394 aa  130  8.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  27.2 
 
 		 348 aa  126  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  28.37 
 
 		 347 aa  125  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  30.28 
 
 		 323 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  29.12 
 
 		 372 aa  124  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  28.38 
 
 		 354 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  25.96 
 
 		 364 aa  121  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  25.54 
 
 		 343 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2275  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  24.8 
 
 		 380 aa  114  8.000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000015469  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  27.44 
 
 		 402 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  26.77 
 
 		 316 aa  112  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  27.61 
 
 		 355 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  28.19 
 
 		 354 aa  111  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  27.61 
 
 		 351 aa  110  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  28.27 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.95 
 
 		 358 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0793  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.32 
 
 		 371 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.856458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  28.49 
 
 		 343 aa  109  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  32.13 
 
 		 347 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  26.74 
 
 		 345 aa  108  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  24.23 
 
 		 343 aa  108  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  27.97 
 
 		 309 aa  108  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  27.35 
 
 		 343 aa  108  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  28.52 
 
 		 314 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  28.09 
 
 		 360 aa  107  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  27.01 
 
 		 327 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  27.75 
 
 		 343 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  27.56 
 
 		 343 aa  107  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  27.86 
 
 		 344 aa  106  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  26.3 
 
 		 326 aa  106  2e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  27.19 
 
 		 315 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  27.45 
 
 		 321 aa  104  6e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  25.68 
 
 		 351 aa  103  8e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  29.39 
 
 		 317 aa  103  8e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  28.89 
 
 		 328 aa  103  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3250  selenophosphate synthetase  25.51 
 
 		 351 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.433054  normal  0.299232 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  28.75 
 
 		 320 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  24.46 
 
 		 316 aa  103  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  25.73 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  24.71 
 
 		 320 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1727  selenophosphate synthetase  25.43 
 
 		 355 aa  102  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000666487 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  26.36 
 
 		 357 aa  102  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  25.07 
 
 		 349 aa  102  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2860  selenide, water dikinase  23.14 
 
 		 350 aa  101  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  28.36 
 
 		 357 aa  101  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  27.94 
 
 		 317 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  27.92 
 
 		 328 aa  100  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  32.51 
 
 		 378 aa  100  8e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  28.37 
 
 		 346 aa  100  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  26.65 
 
 		 344 aa  100  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2844  selenophosphate synthetase  26.38 
 
 		 369 aa  100  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0228  selenophosphate synthetase  27.4 
 
 		 347 aa  100  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0643475  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  26 
 
 		 352 aa  99.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  26.11 
 
 		 381 aa  99  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  27.95 
 
 		 352 aa  98.6  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  30.49 
 
 		 325 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  25.43 
 
 		 353 aa  99  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  27.78 
 
 		 348 aa  98.6  4e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  27.01 
 
 		 357 aa  98.2  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  27.69 
 
 		 340 aa  98.2  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  25.27 
 
 		 358 aa  97.8  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  27.51 
 
 		 358 aa  97.4  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2084  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.46 
 
 		 366 aa  97.4  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  25.8 
 
 		 350 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  25.48 
 
 		 319 aa  97.1  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  27.2 
 
 		 352 aa  96.3  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0724  selenophosphate synthetase  28.3 
 
 		 348 aa  95.9  2e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  26.85 
 
 		 291 aa  96.3  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1198  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.54 
 
 		 367 aa  95.5  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.209232  hitchhiker  0.00325073 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  25.58 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3450  selenophosphate synthetase  25.51 
 
 		 351 aa  95.5  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.111292  normal  0.645552 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  26.38 
 
 		 351 aa  95.1  4e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>