More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0304 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_03251  selenide,water dikinase  94.74 
 
 
723 aa  1402    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.844451  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03351  selenide,water dikinase  67.96 
 
 
722 aa  1018    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.257953  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0304  selenide, water dikinase  100 
 
 
723 aa  1467    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03261  selenide,water dikinase  95.44 
 
 
723 aa  1410    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03281  selenide,water dikinase  39.65 
 
 
727 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25471  selenide,water dikinase  36.64 
 
 
730 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1667  selenide,water dikinase  38.47 
 
 
726 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.854134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03811  selenide,water dikinase  38.86 
 
 
726 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0186  selenide,water dikinase  36.45 
 
 
675 aa  471  1.0000000000000001e-131  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00925362 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0214  selenide,water dikinase  37.14 
 
 
675 aa  435  1e-120  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_41986  predicted protein  25.62 
 
 
796 aa  223  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.508605 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3350  selenide, water dikinase  25.94 
 
 
709 aa  204  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1544  AIR synthase related protein-like  25.39 
 
 
720 aa  204  7e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.134169  normal  0.0275884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1613  selenide, water dikinase  25.61 
 
 
765 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4785  selenophosphate synthase  28.38 
 
 
767 aa  189  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.211617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3461  AIR synthase related protein-like  23.75 
 
 
717 aa  177  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_48952  predicted protein  24.59 
 
 
791 aa  130  8.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3482  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.84 
 
 
386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.254149 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2621  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.97 
 
 
386 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1776  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  26.32 
 
 
379 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  26.14 
 
 
327 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1707  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.07 
 
 
379 aa  101  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000807501 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1103  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  27.06 
 
 
372 aa  99  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1925  selenophosphate synthase  26.6 
 
 
349 aa  99  3e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25360  selenium donor protein  25.52 
 
 
314 aa  98.6  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.592311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  27.3 
 
 
340 aa  98.6  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  27.69 
 
 
317 aa  97.8  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  25.95 
 
 
317 aa  97.4  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  28.12 
 
 
354 aa  97.1  9e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1021  selenophosphate synthetase  25.34 
 
 
355 aa  96.7  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.500937  decreased coverage  0.00150941 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  25.8 
 
 
358 aa  95.1  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  27.46 
 
 
323 aa  95.1  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2464  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.22 
 
 
374 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  25.16 
 
 
325 aa  94.4  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  24.54 
 
 
309 aa  93.6  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  27.39 
 
 
291 aa  92.8  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  24.78 
 
 
351 aa  92.8  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  27.42 
 
 
348 aa  92.4  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  23.72 
 
 
337 aa  92  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  26.03 
 
 
360 aa  90.9  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4368  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.7 
 
 
358 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  24.44 
 
 
355 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  24.65 
 
 
352 aa  90.1  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.18 
 
 
364 aa  89.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.803543  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  26.33 
 
 
350 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  25.71 
 
 
326 aa  88.6  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  25.48 
 
 
351 aa  88.6  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  23.78 
 
 
321 aa  87.8  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  27.6 
 
 
378 aa  87.8  7e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  25.15 
 
 
316 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  25.62 
 
 
347 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1868  selenophosphate synthetase  24.18 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000994537  decreased coverage  0.00000520996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  23.87 
 
 
316 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3291  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.58 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.208322  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  25.86 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0284  selenophosphate synthase  26.5 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  24.93 
 
 
344 aa  84.7  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  24.65 
 
 
358 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  26.51 
 
 
342 aa  84  0.000000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3605  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.75 
 
 
366 aa  84  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  24.78 
 
 
354 aa  84  0.00000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  24.5 
 
 
347 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  26.97 
 
 
314 aa  83.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  25.56 
 
 
353 aa  84  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01733  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00709859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1878  selenide, water dikinase  23.9 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000247238  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.92 
 
 
366 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  27.61 
 
 
348 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01721  hypothetical protein  23.9 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0120641  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0065  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein  25.4 
 
 
369 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2019  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190113  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  24.37 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1848  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000400465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  23.26 
 
 
357 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1987  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82.8  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00136088  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2484  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00104614  normal  0.288495 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3655  hypothetical protein  21.56 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169706 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1427  selenophosphate synthetase  23.9 
 
 
347 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000127521  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  23.26 
 
 
354 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1751  selenophosphate synthetase  26.27 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0768  selenide, water dikinase  24.57 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.306081  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  24.35 
 
 
671 aa  81.6  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  22.51 
 
 
346 aa  81.3  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0287  selenophosphate synthetase  23.32 
 
 
357 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  25.82 
 
 
343 aa  80.9  0.00000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  24.44 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  24.44 
 
 
348 aa  80.9  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0711  selenophosphate synthetase  24.81 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  23.42 
 
 
348 aa  80.1  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3386  putative selenide, water dikinase  22.48 
 
 
402 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.25024  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2344  selenophosphate synthetase  24.86 
 
 
348 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000222806  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0151  selenophosphate synthetase  25 
 
 
356 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.270141  normal  0.0151469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1601  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.51 
 
 
381 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  27.05 
 
 
343 aa  80.5  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  24.08 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1022  selenophosphate synthetase  24.41 
 
 
359 aa  79.7  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000499112  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  25.49 
 
 
357 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
357 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  22.99 
 
 
354 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2135  selenophosphate synthetase  23.14 
 
 
356 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>