78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0130 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0130  AIR synthase-like protein  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.633994  normal  0.0459155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1773  AIR synthase-like protein  97.26 
 
 
293 aa  583  1e-166  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0690  AIR synthase-like protein  94.86 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0038  AIR synthase related protein  83.28 
 
 
293 aa  522  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0087  AIR synthase-like protein  71.43 
 
 
294 aa  456  1e-127  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.81 
 
 
747 aa  64.7  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  26.8 
 
 
328 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.68 
 
 
737 aa  58.5  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.91 
 
 
740 aa  55.8  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.45 
 
 
754 aa  55.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  27.43 
 
 
481 aa  55.1  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  30.73 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.78 
 
 
740 aa  54.7  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.71 
 
 
745 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.08 
 
 
328 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.43 
 
 
743 aa  53.5  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.4 
 
 
721 aa  52.4  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.26 
 
 
740 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.26 
 
 
740 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.43 
 
 
744 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  25.12 
 
 
327 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  27.37 
 
 
347 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.27 
 
 
719 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.31 
 
 
736 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  20.65 
 
 
328 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.48 
 
 
739 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  26.29 
 
 
479 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1277  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.46 
 
 
744 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.31 
 
 
736 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  25.71 
 
 
486 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  28.57 
 
 
273 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2951  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.9 
 
 
746 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.75 
 
 
723 aa  46.6  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0229678 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  25.43 
 
 
319 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  24.44 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  25.74 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.18 
 
 
325 aa  46.2  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1596  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.9 
 
 
740 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.122735 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0684  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.54 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.08 
 
 
735 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.18 
 
 
733 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  24.64 
 
 
327 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1449  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.1 
 
 
730 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  28.71 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1591  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.74 
 
 
736 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.58 
 
 
738 aa  45.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  23.21 
 
 
331 aa  45.4  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  23.96 
 
 
334 aa  45.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.59 
 
 
731 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2052  selenophosphate synthetase  24.89 
 
 
357 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.752159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  23.86 
 
 
327 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0101  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.92 
 
 
693 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00123844  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0894  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.79 
 
 
719 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139167 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  26.27 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.64 
 
 
693 aa  44.3  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389559  normal  0.625325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0005  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.13 
 
 
737 aa  43.9  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0508779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  26.27 
 
 
356 aa  43.9  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.24 
 
 
331 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0917  AIR synthase related protein  25.86 
 
 
333 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0010  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.57 
 
 
741 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4216  thiamine monophosphate kinase  26.06 
 
 
322 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1398  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.26 
 
 
334 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.301712  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  23.26 
 
 
354 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  25.35 
 
 
360 aa  43.5  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.89 
 
 
337 aa  43.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  22.07 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  23.26 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  23.26 
 
 
357 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0692  thiamine-monophosphate kinase  23.62 
 
 
327 aa  43.1  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00384986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1278  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.26 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0762  AIR synthase-like protein  24.56 
 
 
321 aa  43.1  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.353751  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0678  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.67 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  23.47 
 
 
348 aa  42.7  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21270  AIR synthase related protein domain protein  22.73 
 
 
348 aa  42.7  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.0242e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2586  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.5 
 
 
739 aa  42.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.236603 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  28.49 
 
 
378 aa  42.4  0.009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1192  thiamine-monophosphate kinase  26.79 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.117705  normal  0.779826 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4326  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.41 
 
 
751 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.843538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>