55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0690 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0690  AIR synthase-like protein  100 
 
 
293 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.10679  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1773  AIR synthase-like protein  95.56 
 
 
293 aa  577  1e-164  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0130  AIR synthase-like protein  94.86 
 
 
293 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.633994  normal  0.0459155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0038  AIR synthase related protein  82.88 
 
 
293 aa  523  1e-147  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0087  AIR synthase-like protein  69.62 
 
 
294 aa  441  1e-123  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2197  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.7 
 
 
747 aa  62  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.541923 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7579  selenophosphate synthetase-related protein  26.8 
 
 
328 aa  58.9  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2074  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  27.94 
 
 
754 aa  57.4  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.905222  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0863  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.48 
 
 
737 aa  56.2  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.472862  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0680  hydrogenase expression/formation protein HypE  27.38 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0048  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.67 
 
 
328 aa  53.5  0.000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.273112  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4689  AIR synthase related protein  26.82 
 
 
481 aa  53.5  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1852  hydrogenase expression/formation protein  27.93 
 
 
347 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.138708  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0708  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  26.17 
 
 
740 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2389  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.69 
 
 
740 aa  50.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1411  putative thiamine-monophosphate kinase  25.62 
 
 
327 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0935  hydrogenase expression/formation protein HypE  24.12 
 
 
331 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0141741  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2059  GCN5-related N-acetyltransferase  25.82 
 
 
479 aa  49.3  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0829  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.76 
 
 
740 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0837  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.76 
 
 
740 aa  48.5  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.41714  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1022  hydrogenase expression/formation protein HypE  26.7 
 
 
331 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.260397  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0101  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.11 
 
 
693 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00123844  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6662  GCN5-related N-acetyltransferase  24.3 
 
 
486 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0223324  normal  0.900242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1934  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.68 
 
 
743 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1735  hydrogenase expression/formation protein HypE  25.12 
 
 
331 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.391898  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1941  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.9 
 
 
745 aa  46.6  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4564  AIR synthase-like protein  20.65 
 
 
328 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.299231  normal  0.430179 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0496  hypothetical protein  24.85 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2712  AIR synthase related protein domain protein  23.71 
 
 
327 aa  46.6  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1111  hypothetical protein  25 
 
 
325 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.40084 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1681  AIR synthase related protein domain protein  24.87 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0131  thiamin-monophosphate kinase  27.72 
 
 
326 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1912  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.69 
 
 
693 aa  45.8  0.0009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.389559  normal  0.625325 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1118  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.41 
 
 
721 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1619  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  22.35 
 
 
739 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2144  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25 
 
 
744 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.470328  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1966  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.04 
 
 
731 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2173  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.17 
 
 
719 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4748  AIR synthase related protein  23.03 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0560199  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1060  AIR synthase related protein-like protein  25 
 
 
327 aa  44.3  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0149128  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0723  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.69 
 
 
738 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3475  hypothetical protein  23.5 
 
 
342 aa  44.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.451422  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0773  thiamine monophosphate kinase  27.82 
 
 
273 aa  44.3  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3713  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  24.5 
 
 
736 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.755949  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2777  hydrogenase expression/formation protein HypE  23.44 
 
 
337 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1752  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.23 
 
 
736 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5401  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.08 
 
 
735 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2665  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.28 
 
 
727 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367188  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  25.15 
 
 
319 aa  42.7  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2622  AIR synthase related protein domain protein  28.05 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5056  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  25.51 
 
 
807 aa  43.1  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0521  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  21.79 
 
 
733 aa  42.7  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3013  hydrogenase expression/formation protein HypE  28.05 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1630  phosphoribosylformylglycinamidine synthase II  23.19 
 
 
781 aa  42.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.503896  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1778  selenide, water dikinase  27.49 
 
 
378 aa  42.4  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>