More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3264 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_3137  phosphoenolpyruvate synthase  43.78 
 
 
868 aa  741    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3140  phosphoenolpyruvate synthase  43.52 
 
 
868 aa  721    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.103594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2899  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 
868 aa  743    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.407068  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2868  phosphoenolpyruvate synthase  43.9 
 
 
868 aa  738    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.424665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2825  phosphoenolpyruvate synthase  43.67 
 
 
869 aa  726    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2130  phosphoenolpyruvate synthase  44.31 
 
 
868 aa  749    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3264  phosphoenolpyruvate synthase  100 
 
 
890 aa  1837    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000174113  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3119  phosphoenolpyruvate synthase  44.07 
 
 
869 aa  734    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4939  phosphoenolpyruvate synthase  43.48 
 
 
865 aa  723    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0930681 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3116  phosphoenolpyruvate synthase  44.12 
 
 
868 aa  743    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2960  phosphoenolpyruvate synthase  43.32 
 
 
866 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000180391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3108  phosphoenolpyruvate synthase  44.35 
 
 
868 aa  753    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.721717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1951  phosphoenolpyruvate synthase  41.47 
 
 
871 aa  689    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2894  phosphoenolpyruvate synthase  44 
 
 
868 aa  744    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.497322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1117  phosphoenolpyruvate synthase  42.06 
 
 
891 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3580  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.2 
 
 
887 aa  670    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0644  phosphoenolpyruvate synthase  44.02 
 
 
870 aa  723    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0824821 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2728  phosphoenolpyruvate synthase  45.9 
 
 
874 aa  773    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.336193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0620  phosphoenolpyruvate synthase  38.57 
 
 
842 aa  602  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3294  phosphoenolpyruvate synthase  36.32 
 
 
837 aa  521  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0508  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.89 
 
 
903 aa  498  1e-139  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.93502  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0384  phosphoenolpyruvate synthase  34.87 
 
 
907 aa  469  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0751  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  33.41 
 
 
887 aa  459  1e-127  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0402174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5613  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  33.96 
 
 
873 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.650843  normal  0.554799 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0474  pyruvate, water dikinase  33.83 
 
 
906 aa  420  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.247096  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0605  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  32.8 
 
 
950 aa  410  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00206316 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5551  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding protein  31.8 
 
 
826 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0952263  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1713  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  32.49 
 
 
867 aa  400  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.0493713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4777  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  30.52 
 
 
821 aa  352  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2632  pyruvate, water dikinase  30.89 
 
 
886 aa  349  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.514233  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1894  Phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase-like protein  31.89 
 
 
971 aa  326  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2649  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  28.18 
 
 
884 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1730  phosphoenolpyruvate synthase  49.38 
 
 
781 aa  295  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1622  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  45.43 
 
 
891 aa  281  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1544  phosphoenolpyruvate synthase  45.71 
 
 
758 aa  280  6e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00247245  hitchhiker  0.0000582812 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0588  phosphoenolpyruvate synthase  44.92 
 
 
824 aa  267  7e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2598  phosphoenolpyruvate synthase  45.69 
 
 
785 aa  265  4e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1637  phosphoenolpyruvate synthase  45.28 
 
 
754 aa  264  6e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  45.68 
 
 
782 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0529  phosphoenolpyruvate synthase  40.87 
 
 
758 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000746686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2079  phosphoenolpyruvate synthase  43.31 
 
 
761 aa  256  2.0000000000000002e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_494  phosphoenolpyruvate synthase/pyruvate phosphate dikinase  40.06 
 
 
758 aa  254  5.000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000095153  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3009  phosphoenolpyruvate synthase  27.61 
 
 
885 aa  254  5.000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963609  normal  0.276048 
 
 
-
 
NC_002936  DET0554  phosphoenolpyruvate synthase  39.75 
 
 
758 aa  251  4e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.435689  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2610  phosphoenolpyruvate synthase  43.31 
 
 
762 aa  251  4e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4720  phosphoenolpyruvate synthase  45.37 
 
 
785 aa  251  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.878278  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0271  phosphoenolpyruvate synthase  43.79 
 
 
769 aa  249  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4143  phosphoenolpyruvate synthase  26.68 
 
 
885 aa  249  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.917793  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0801  phosphoenolpyruvate synthase  44.73 
 
 
780 aa  248  4e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2573  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  39.89 
 
 
835 aa  247  6e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0592  phosphoenolpyruvate synthase  43.08 
 
 
788 aa  246  9.999999999999999e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.245818  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1849  phosphoenolpyruvate synthase  42.49 
 
 
762 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0346  phosphoenolpyruvate synthase  44.37 
 
 
758 aa  246  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000716638 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0490  phosphoenolpyruvate synthase  44.41 
 
 
758 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1573  phosphoenolpyruvate synthase  43.38 
 
 
758 aa  244  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0419  phosphoenolpyruvate synthase  43.05 
 
 
757 aa  242  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603284  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4402  phosphoenolpyruvate synthase  41.59 
 
 
799 aa  240  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2165  phosphoenolpyruvate synthase  41.72 
 
 
761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2997  phosphoenolpyruvate synthase  40.58 
 
 
760 aa  233  1e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.804311  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1291  phosphoenolpyruvate synthase  40.38 
 
 
803 aa  232  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12720  phosphoenolpyruvate synthase  41.77 
 
 
764 aa  232  3e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1157  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.37 
 
 
869 aa  231  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2857  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 
892 aa  228  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6941  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  37.78 
 
 
810 aa  227  7e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.951528  normal  0.75146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3615  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  36.91 
 
 
902 aa  227  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5062  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding protein  40.13 
 
 
840 aa  224  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 
809 aa  224  7e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0349  phosphoenolpyruvate synthase, putative  41.32 
 
 
825 aa  224  8e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  38.37 
 
 
808 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2845  phosphoenolpyruvate synthase  39.41 
 
 
805 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000642481  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1453  phosphoenolpyruvate synthase  38.86 
 
 
794 aa  223  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0718621  normal  0.314007 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1445  phosphoenolpyruvate synthase  37.46 
 
 
812 aa  222  3e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.123077 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2072  phosphoenolpyruvate synthase  39.22 
 
 
789 aa  221  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.908755  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1204  phosphoenolpyruvate synthase  39.32 
 
 
810 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.490144 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  39.7 
 
 
794 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  39.46 
 
 
795 aa  221  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1995  pyruvate, water dikinase  37.07 
 
 
359 aa  220  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0783818  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1433  phosphoenolpyruvate synthase  38.81 
 
 
801 aa  220  8.999999999999998e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  39.44 
 
 
809 aa  219  1e-55  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2435  phosphoenolpyruvate synthase  40.06 
 
 
798 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2009  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
791 aa  219  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000127973  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1421  phosphoenolpyruvate synthase  39.46 
 
 
795 aa  218  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0887708  decreased coverage  0.00267655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  37.91 
 
 
790 aa  218  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1362  phosphoenolpyruvate synthase  39.16 
 
 
795 aa  218  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.106247  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1186  phosphoenolpyruvate synthase  38.35 
 
 
804 aa  218  5e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  37.72 
 
 
789 aa  217  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  38.25 
 
 
789 aa  217  7e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3829  phosphoenolpyruvate synthase  38.92 
 
 
760 aa  216  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.424859  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 
790 aa  216  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2243  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
789 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0079831  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1592  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
789 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000471516  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  39.76 
 
 
815 aa  217  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1736  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
789 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00335783  normal  0.358822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  38.44 
 
 
792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  38.62 
 
 
790 aa  215  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  39.39 
 
 
792 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1863  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
789 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0183397  hitchhiker  0.0000000630455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2601  phosphoenolpyruvate synthase  38.02 
 
 
789 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000925203  normal  0.0344247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>