68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1269 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1269  leucine-rich repeat-containing protein  100 
 
 
360 aa  736    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.407419  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  25.37 
 
 
1041 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  28.28 
 
 
757 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
444 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  30.16 
 
 
476 aa  53.5  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  30 
 
 
396 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  29.46 
 
 
1015 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  28.41 
 
 
892 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  27.67 
 
 
713 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  27.48 
 
 
508 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
436 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  28.87 
 
 
296 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.1 
 
 
1107 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
444 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  29.85 
 
 
2132 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4625  leucine-rich repeat protein  28.57 
 
 
569 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.57 
 
 
863 aa  50.4  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 
473 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  31.63 
 
 
416 aa  50.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  34.09 
 
 
439 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0408  hypothetical protein  23.65 
 
 
293 aa  49.7  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2798  serine/threonine protein kinase  32.69 
 
 
437 aa  49.3  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.424689  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  24.07 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  28.18 
 
 
451 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1475  hypothetical protein  33.73 
 
 
225 aa  48.5  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.661845  normal  0.169207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  28.18 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5365  WGR domain protein  31.91 
 
 
1088 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359865  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 
440 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  31.31 
 
 
648 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  28.83 
 
 
1263 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  28.42 
 
 
307 aa  47.4  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  24.79 
 
 
2324 aa  47  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  25.68 
 
 
482 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  28.81 
 
 
293 aa  46.6  0.0006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  27.1 
 
 
802 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  28.18 
 
 
451 aa  46.6  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0691  serine/threonine protein kinase  26.62 
 
 
441 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
459 aa  46.2  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  29.09 
 
 
446 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  26.52 
 
 
867 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  28.18 
 
 
451 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  27.34 
 
 
421 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  28.23 
 
 
471 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  24.36 
 
 
1749 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  26.47 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  26.71 
 
 
434 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  26.62 
 
 
937 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 
412 aa  45.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
447 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  29.41 
 
 
886 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  28.57 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
445 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  30.43 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4410  serine/threonine protein kinase  27.42 
 
 
469 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.071312 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  26.62 
 
 
937 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  24.64 
 
 
437 aa  44.3  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2596  leucine-rich repeat-containing protein  32.89 
 
 
151 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5300  serine/threonine protein kinase  29.09 
 
 
437 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  36.92 
 
 
475 aa  43.9  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 
447 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  33.33 
 
 
559 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  31.52 
 
 
242 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 
453 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  32.1 
 
 
204 aa  43.5  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 
437 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  28.18 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>