68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0593 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 186 aa  368  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  66.85 
 
 		 184 aa  270  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  66.85 
 
 		 184 aa  270  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  68.51 
 
 		 184 aa  266  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  66.3 
 
 		 184 aa  265  4e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  41.57 
 
 		 182 aa  156  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  42.7 
 
 		 182 aa  151  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  40.45 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  41.01 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  41.67 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  43.03 
 
 		 180 aa  145  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  39.11 
 
 		 185 aa  144  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  41.71 
 
 		 182 aa  144  8.000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 179 aa  140  9e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  39.11 
 
 		 192 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  35.52 
 
 		 180 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  38.42 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  33.15 
 
 		 181 aa  122  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  38.29 
 
 		 174 aa  122  3e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  33.52 
 
 		 184 aa  121  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  34.46 
 
 		 179 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  41.46 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  31.28 
 
 		 197 aa  111  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  37.06 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  40.18 
 
 		 186 aa  101  8e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  39.29 
 
 		 176 aa  99  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  35.71 
 
 		 174 aa  94.7  6e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  35 
 
 		 184 aa  91.7  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  27.85 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  29.82 
 
 		 402 aa  65.1  0.0000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  27.27 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  28.97 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  27.27 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  23.53 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  23.95 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  25 
 
 		 257 aa  53.9  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  23.6 
 
 		 196 aa  51.6  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.44 
 
 		 709 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1635  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.71 
 
 		 732 aa  48.5  0.00006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.000929838  normal  0.469097 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0114  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.03 
 
 		 741 aa  46.2  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.613671  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1689  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  44.44 
 
 		 728 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0382  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  40.38 
 
 		 714 aa  44.7  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.320403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.24 
 
 		 732 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2017  polyribonucleotide nucleotidyltransferase  52.38 
 
 		 718 aa  44.3  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000536157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3583  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  30.93 
 
 		 770 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2132  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  35.53 
 
 		 773 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0666  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  45.16 
 
 		 728 aa  43.9  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0506  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  42.86 
 
 		 734 aa  44.3  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.58 
 
 		 686 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00293848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2047  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36.62 
 
 		 769 aa  43.9  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0512862  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0599  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  40.32 
 
 		 736 aa  43.5  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1381  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.18 
 
 		 785 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.491374  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.52 
 
 		 698 aa  43.5  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000243364  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1339  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  41.18 
 
 		 786 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133995  hitchhiker  0.000450974 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0784  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  36 
 
 		 767 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1189  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.33 
 
 		 729 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.266903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3279  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.88 
 
 		 718 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.825925 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  29.91 
 
 		 266 aa  42  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0418  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.88 
 
 		 700 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5112  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  39.22 
 
 		 825 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.191033  normal  0.121153 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2478  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.89 
 
 		 744 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0963383  normal  0.320365 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1707  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.39 
 
 		 703 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3555  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.18 
 
 		 729 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.50127 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1068  guanosine pentaphosphate synthetase I/polyribonucleotide nucleotidyltransferase  34.67 
 
 		 773 aa  41.2  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.63376  normal  0.0171355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10960  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  33.82 
 
 		 743 aa  41.2  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000522629  unclonable  0.00000000397306 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3785  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  29.79 
 
 		 708 aa  41.2  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.668029  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1497  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  39.06 
 
 		 767 aa  40.8  0.01  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00694451 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0552  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 734 aa  40.8  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.368343  normal  0.96834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>