42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1477 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  86.41 
 
 		 184 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  86.41 
 
 		 184 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  86.96 
 
 		 184 aa  327  6e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  68.51 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  49.44 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  48.02 
 
 		 182 aa  155  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  44.94 
 
 		 180 aa  148  3e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  44 
 
 		 178 aa  148  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  44.07 
 
 		 179 aa  148  5e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  42.78 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  46.29 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  46.06 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  45.71 
 
 		 174 aa  141  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 180 aa  141  6e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  44.89 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  45.03 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  41.9 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  35.36 
 
 		 181 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  37.85 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  43.65 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  36.26 
 
 		 184 aa  111  7.000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  32.39 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 		 176 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  39.71 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  37.5 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  39.42 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  38.1 
 
 		 174 aa  97.8  7e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  31.17 
 
 		 415 aa  72.8  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  28.48 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  31.19 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  33.33 
 
 		 358 aa  65.5  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  30.3 
 
 		 402 aa  64.7  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  28.14 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  26.19 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  26.71 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  27.78 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  27.46 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1041  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  38.46 
 
 		 698 aa  43.1  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000243364  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.33 
 
 		 709 aa  42.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0382  Polyribonucleotide nucleotidyltransferase  38.78 
 
 		 714 aa  41.6  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.320403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10380  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.94 
 
 		 753 aa  40.8  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0265534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>