33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0851 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  100 
 
 
186 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  81.61 
 
 
176 aa  295  2e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  79.07 
 
 
174 aa  274  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  71.67 
 
 
184 aa  273  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  39.08 
 
 
184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 
184 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  35.12 
 
 
197 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  39.71 
 
 
184 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 
184 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  34.38 
 
 
189 aa  102  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  42.98 
 
 
182 aa  99.8  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  36.69 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  39.29 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  37.5 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  41.38 
 
 
180 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  33.58 
 
 
181 aa  90.1  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  39.66 
 
 
182 aa  88.2  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  37.76 
 
 
190 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  40.18 
 
 
186 aa  84.7  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 
182 aa  84.7  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  35.77 
 
 
192 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  40.52 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  31.14 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  38.74 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  30.28 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  35.34 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  32 
 
 
174 aa  65.9  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  31.09 
 
 
228 aa  61.6  0.000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  32.5 
 
 
258 aa  61.2  0.000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  31.33 
 
 
266 aa  60.5  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  32.41 
 
 
196 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  33.88 
 
 
257 aa  60.5  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>