37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2793 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 179 aa  359  1e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  63.54 
 
 		 181 aa  240  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  64.41 
 
 		 180 aa  239  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  58.66 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  52.78 
 
 		 180 aa  190  8e-48  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  43.68 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  42.7 
 
 		 182 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  50.6 
 
 		 174 aa  148  4e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  41.21 
 
 		 182 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  40.78 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  39.11 
 
 		 185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  37.99 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  39.08 
 
 		 180 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 184 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  41.24 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  40.11 
 
 		 182 aa  128  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  37.85 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  35.59 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  37.35 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  37.58 
 
 		 189 aa  91.3  7e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  36.96 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  35.71 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  34.34 
 
 		 174 aa  77.4  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  33.57 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  35.34 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  33.61 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  32.2 
 
 		 257 aa  47.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  29.89 
 
 		 415 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  28.41 
 
 		 379 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  28.74 
 
 		 358 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  25.47 
 
 		 356 aa  45.4  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  27.35 
 
 		 228 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  26.44 
 
 		 402 aa  43.9  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  30.56 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  26.49 
 
 		 258 aa  41.6  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>