23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32864 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  100 
 
 		 415 aa  848    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  52.38 
 
 		 379 aa  402  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  64.33 
 
 		 358 aa  396  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  60.66 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  64.37 
 
 		 402 aa  353  4e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  31.17 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  31.82 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  31.82 
 
 		 184 aa  71.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  31.82 
 
 		 184 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  33.93 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  28.05 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  36 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  30.58 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  29.63 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  35.35 
 
 		 180 aa  57  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  25.96 
 
 		 178 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  27.27 
 
 		 186 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  22.41 
 
 		 257 aa  47.4  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  27.68 
 
 		 180 aa  47.4  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  26 
 
 		 189 aa  47.4  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  29.89 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  25.16 
 
 		 228 aa  43.9  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  27.05 
 
 		 184 aa  43.1  0.009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>