22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_40963 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  100 
 
 		 356 aa  720    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  66.78 
 
 		 358 aa  421  1e-117  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  60.2 
 
 		 379 aa  385  1e-106  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  60.66 
 
 		 415 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  66.67 
 
 		 402 aa  344  1e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  31.13 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  31.13 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  31.13 
 
 		 184 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  28.48 
 
 		 184 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  26.49 
 
 		 182 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  28.93 
 
 		 182 aa  55.8  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  25 
 
 		 192 aa  55.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  29.03 
 
 		 180 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  26.45 
 
 		 185 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  26.45 
 
 		 182 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  27.85 
 
 		 186 aa  50.1  0.00006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  23.66 
 
 		 180 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  26.61 
 
 		 184 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  23.66 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  25.47 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  21.94 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  24.21 
 
 		 189 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>