36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_35737 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  100 
 
 
228 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  55.17 
 
 
257 aa  255  3e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  61.2 
 
 
196 aa  253  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  57.29 
 
 
258 aa  240  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  60 
 
 
266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  33.11 
 
 
184 aa  75.1  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  32.37 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  30.77 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  30.77 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  32.41 
 
 
184 aa  65.1  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  28.14 
 
 
184 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  31.09 
 
 
186 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  30.91 
 
 
178 aa  59.3  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  30.77 
 
 
179 aa  58.9  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  36.21 
 
 
197 aa  58.9  0.00000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  28.15 
 
 
182 aa  58.5  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  37.17 
 
 
189 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  29.41 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  30.7 
 
 
174 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  28.57 
 
 
176 aa  56.2  0.0000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  26.57 
 
 
180 aa  55.8  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  24.1 
 
 
190 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  28.68 
 
 
192 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  29.58 
 
 
182 aa  54.7  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  27.82 
 
 
181 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  31.88 
 
 
185 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  32.2 
 
 
180 aa  51.6  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  44.26 
 
 
174 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  22.35 
 
 
186 aa  50.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  24.7 
 
 
180 aa  49.3  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  34.34 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  28.21 
 
 
178 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  25.16 
 
 
415 aa  44.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  27.35 
 
 
179 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  26.49 
 
 
379 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  23.45 
 
 
356 aa  42.7  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>