23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05510 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  100 
 
 		 402 aa  824    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  53.46 
 
 		 356 aa  378  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  56.21 
 
 		 358 aa  379  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  52.86 
 
 		 415 aa  371  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  49.35 
 
 		 379 aa  366  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  30.3 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  30.3 
 
 		 184 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  30.3 
 
 		 184 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  30.3 
 
 		 184 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  28.7 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  29.57 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  28.04 
 
 		 185 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  27.1 
 
 		 192 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  29.82 
 
 		 186 aa  51.6  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  32.32 
 
 		 180 aa  51.2  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  26.61 
 
 		 182 aa  48.9  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  25.27 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  26.05 
 
 		 184 aa  47  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  22.91 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  25.5 
 
 		 196 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  29.36 
 
 		 182 aa  44.3  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  26.96 
 
 		 180 aa  43.9  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  26.44 
 
 		 179 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>