40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1627 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 184 aa  367  1e-101  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  97.83 
 
 		 184 aa  358  3e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  86.41 
 
 		 184 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  66.85 
 
 		 186 aa  249  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  49.44 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  48.57 
 
 		 182 aa  164  9e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  44.57 
 
 		 178 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  45 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  44.07 
 
 		 179 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  45.71 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 182 aa  145  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  44.85 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  43.27 
 
 		 185 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  41.34 
 
 		 192 aa  137  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 174 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  36.46 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  36.36 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  37.79 
 
 		 184 aa  111  5e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  42.86 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  45.54 
 
 		 176 aa  107  8.000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  44.64 
 
 		 186 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  36.81 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  36.73 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  37.41 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  31.13 
 
 		 356 aa  75.1  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  31.82 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  30.3 
 
 		 402 aa  69.3  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  30.77 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  29.32 
 
 		 379 aa  66.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  33.83 
 
 		 358 aa  65.9  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  27.38 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  26.99 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  28.67 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  28.05 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0203  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  32.84 
 
 		 709 aa  42  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07600  polyribonucleotide nucleotidyltransferase (polynucleotide phosphorylase)  32.26 
 
 		 742 aa  41.6  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.722392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>