37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2500 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 180 aa  360  4e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  64.41 
 
 		 179 aa  239  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  58.1 
 
 		 181 aa  223  9e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  59.09 
 
 		 179 aa  214  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  51.98 
 
 		 180 aa  186  2e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  47.19 
 
 		 178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  44.38 
 
 		 182 aa  161  5.0000000000000005e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  44.38 
 
 		 182 aa  157  9e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  44 
 
 		 182 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  42.94 
 
 		 182 aa  150  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  41.57 
 
 		 185 aa  148  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  43.26 
 
 		 192 aa  149  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  40.88 
 
 		 184 aa  148  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  51.5 
 
 		 174 aa  147  8e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 184 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  42.01 
 
 		 180 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  40.11 
 
 		 184 aa  141  6e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  34.43 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  39.11 
 
 		 190 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  37.14 
 
 		 197 aa  106  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  40 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  37.69 
 
 		 184 aa  86.3  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  31.16 
 
 		 178 aa  85.5  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  31.14 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  37.84 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  32.17 
 
 		 184 aa  78.6  0.00000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  29.45 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  32.71 
 
 		 257 aa  52  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  32.2 
 
 		 228 aa  51.6  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  27.68 
 
 		 358 aa  50.1  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  35.51 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  26.28 
 
 		 415 aa  48.5  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  30.56 
 
 		 258 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  23.66 
 
 		 356 aa  47.4  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  23.24 
 
 		 379 aa  44.7  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  24.11 
 
 		 402 aa  44.3  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>