46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0171 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 174 aa  346  9e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  58.96 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  57.56 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  55.36 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  55.95 
 
 		 182 aa  203  9e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  54.76 
 
 		 185 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  51.19 
 
 		 192 aa  189  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  53.25 
 
 		 180 aa  187  5.999999999999999e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  50.6 
 
 		 180 aa  184  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  51.5 
 
 		 180 aa  176  2e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  47.31 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  50.6 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  50 
 
 		 179 aa  167  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  45.29 
 
 		 182 aa  159  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  45.71 
 
 		 184 aa  157  9e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 184 aa  149  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  45.14 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  44.05 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  38.29 
 
 		 186 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  43.98 
 
 		 197 aa  121  5e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  36.91 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  34.32 
 
 		 184 aa  94  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  32.52 
 
 		 178 aa  92.8  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  34.97 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  33.73 
 
 		 174 aa  87  1e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  39.25 
 
 		 176 aa  84.7  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  32 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  31.91 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  31.85 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  29.34 
 
 		 258 aa  61.2  0.000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  35.45 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40963  predicted protein  29.6 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32864  predicted protein  28.1 
 
 		 415 aa  57  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45441  predicted protein  30.08 
 
 		 379 aa  56.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05510  rRNA processing-related protein, putative  28.21 
 
 		 402 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909305  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05875  rRNA assembly protein Mis3, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G11380)  28.1 
 
 		 358 aa  51.2  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.782945  normal  0.951317 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  27.78 
 
 		 266 aa  48.1  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  29.14 
 
 		 310 aa  45.8  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4023  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  31.31 
 
 		 756 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.688268  normal  0.0248792 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2350  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.91 
 
 		 754 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.78802  decreased coverage  0.00350864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2083  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.91 
 
 		 759 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.408201  normal  0.158604 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2146  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.91 
 
 		 759 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0744177 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2100  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  30.91 
 
 		 759 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0644051  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2440  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.5 
 
 		 716 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.225847  normal  0.0323804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2522  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  34.38 
 
 		 755 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>