26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_89194 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  100 
 
 
310 aa  625  1e-178  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28758  predicted protein  32.14 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28287  predicted protein  37.42 
 
 
249 aa  77  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000137678  normal  0.525512 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44729  predicted protein  29.91 
 
 
699 aa  68.9  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_24185  predicted protein  27.01 
 
 
413 aa  65.5  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00750774  normal  0.221462 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27317  predicted protein  25 
 
 
321 aa  63.5  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0699942  decreased coverage  0.000232091 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28087  predicted protein  23.88 
 
 
465 aa  60.1  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000149848  normal  0.278973 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15661  predicted protein  28.78 
 
 
651 aa  52.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47861  predicted protein  26.63 
 
 
1234 aa  49.3  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.090651  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04546  KH domain RNA-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02780)  31.3 
 
 
542 aa  48.5  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000459967  normal  0.0749815 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00260  cytoplasm protein, putative  31.52 
 
 
357 aa  48.1  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  28.67 
 
 
185 aa  47.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03070  cytoplasm protein, putative  29.32 
 
 
365 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205748  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  27.81 
 
 
192 aa  47  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76889  PAB1 binding protein  25.3 
 
 
500 aa  45.1  0.001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0374206 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10257  KH domain RNA binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G04940)  36.11 
 
 
465 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  26.8 
 
 
174 aa  44.3  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24530  predicted protein  53.33 
 
 
218 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00133033  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1674  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  33.8 
 
 
703 aa  43.5  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000759629  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40453  predicted protein  33.77 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  27.33 
 
 
182 aa  43.1  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  27.15 
 
 
180 aa  43.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02220  SCP160 protein, putative  21.43 
 
 
1289 aa  42.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  27.74 
 
 
182 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56624  predicted protein  25.63 
 
 
1301 aa  42.7  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.187837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0428  polynucleotide phosphorylase/polyadenylase  37.04 
 
 
721 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000339931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>