13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44729 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44729  predicted protein  100 
 
 		 699 aa  1432    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189195  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04546  KH domain RNA-binding protein (AFU_orthologue; AFUA_2G02780)  28.48 
 
 		 542 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000459967  normal  0.0749815 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62156  predicted protein  21.53 
 
 		 343 aa  62  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.474155  normal  0.0819638 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28758  predicted protein  22.41 
 
 		 340 aa  62  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.79308  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00260  cytoplasm protein, putative  26.77 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03070  cytoplasm protein, putative  29.63 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.205748  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28250  predicted protein  27.95 
 
 		 437 aa  56.2  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.522861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76889  PAB1 binding protein  21.48 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0374206 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_89194  predicted protein  27.23 
 
 		 310 aa  54.3  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.915191  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28287  predicted protein  30.28 
 
 		 249 aa  52  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0000137678  normal  0.525512 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15661  predicted protein  27.32 
 
 		 651 aa  50.8  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.598377 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27317  predicted protein  24.52 
 
 		 321 aa  50.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0699942  decreased coverage  0.000232091 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_40453  predicted protein  28.57 
 
 		 297 aa  45.8  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>