33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1181 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1181  putative RNA-processing protein  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0851  putative RNA-processing protein  79.07 
 
 		 186 aa  274  3e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.701286 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0772  putative RNA-processing protein  76.16 
 
 		 176 aa  267  5e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.41794  normal  0.0119808 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1851  putative RNA-processing protein  72.83 
 
 		 184 aa  261  3e-69  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.916609  normal  0.125825 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0980  putative RNA-processing protein  38.29 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0185  KH domain protein  42.65 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00031707  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0653  putative RNA-processing protein  37.14 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.873833  normal  0.171663 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1001  putative RNA-processing protein  38.1 
 
 		 184 aa  101  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.52348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1477  putative RNA-processing protein  38.1 
 
 		 184 aa  97.8  6e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0190069  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1281  KH domain protein  40 
 
 		 182 aa  97.4  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0287  putative RNA-processing protein  37.41 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.522935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1627  putative RNA-processing protein  37.41 
 
 		 184 aa  97.1  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2457  putative RNA-processing protein  34.56 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0512  putative RNA-processing protein  35.77 
 
 		 197 aa  96.7  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2465  putative RNA-processing protein  32.88 
 
 		 179 aa  91.7  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0000000000949184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1750  putative RNA-processing protein  33.33 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.595903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2094  KH domain protein  39.32 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.472155  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2661  putative RNA-processing protein  39.82 
 
 		 180 aa  84.7  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.285005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1784  putative RNA-processing protein  33.11 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3655  KH domain protein  38.46 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1272  putative RNA-processing protein  34.48 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0593  putative RNA-processing protein  35.71 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.459643  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1409  putative RNA-processing protein  36.52 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2793  putative RNA-processing protein  34.34 
 
 		 179 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000187863  normal  0.0434325 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0700  KH type 1 domain protein  36.94 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.432853  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2500  putative RNA-processing protein  29.45 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0948  putative RNA-processing protein  29.33 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0171  putative RNA-processing protein  33.73 
 
 		 174 aa  67  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35737  predicted protein  30.7 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.230119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05785  Pre-rRNA-processing protein pno1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0Z5]  32.76 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.250915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9929  predicted protein  30.61 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.545391  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69759  Predicted RNA-binding protein Pno1p interacting with Nob1p and involved in 26S proteasome assembly  33.88 
 
 		 257 aa  54.3  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05860  chaperone, putative  37.68 
 
 		 266 aa  52.4  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>